Protein–RNA interactions for Protein: O43196

MSH5, MutS protein homolog 5, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSH5O43196 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MSH5O43196 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MSH5O43196 AC051619.5-201ENST00000559003 736 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MSH5O43196 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MSH5O43196 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MSH5O43196 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
MSH5O43196 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MSH5O43196 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MSH5O43196 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MSH5O43196 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MSH5O43196 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MSH5O43196 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MSH5O43196 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MSH5O43196 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MSH5O43196 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MSH5O43196 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MSH5O43196 CHAC2-201ENST00000295304 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MSH5O43196 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MSH5O43196 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MSH5O43196 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MSH5O43196 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MSH5O43196 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MSH5O43196 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MSH5O43196 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
MSH5O43196 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MSH5O43196 BCAP29-207ENST00000445771 1157 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MSH5O43196 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MSH5O43196 LINC01473-203ENST00000456653 1079 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MSH5O43196 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MSH5O43196 AP003716.1-203ENST00000533670 613 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MSH5O43196 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MSH5O43196 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MSH5O43196 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MSH5O43196 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MSH5O43196 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MSH5O43196 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MSH5O43196 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MSH5O43196 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MSH5O43196 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MSH5O43196 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MSH5O43196 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MSH5O43196 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MSH5O43196 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MSH5O43196 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MSH5O43196 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MSH5O43196 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MSH5O43196 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MSH5O43196 KRTAP4-6-201ENST00000345847 1055 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MSH5O43196 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
MSH5O43196 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MSH5O43196 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MSH5O43196 AC079630.1-201ENST00000412812 585 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MSH5O43196 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MSH5O43196 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MSH5O43196 GRM7-AS3-208ENST00000455623 947 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MSH5O43196 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MSH5O43196 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MSH5O43196 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MSH5O43196 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MSH5O43196 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MSH5O43196 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MSH5O43196 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MSH5O43196 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MSH5O43196 BTG4-203ENST00000525791 1394 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MSH5O43196 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MSH5O43196 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MSH5O43196 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MSH5O43196 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MSH5O43196 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MSH5O43196 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MSH5O43196 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MSH5O43196 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
MSH5O43196 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MSH5O43196 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MSH5O43196 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
MSH5O43196 FAM9B-203ENST00000428477 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MSH5O43196 AC092685.1-201ENST00000447960 1243 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
MSH5O43196 AC009158.1-205ENST00000452511 895 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MSH5O43196 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MSH5O43196 AC109349.1-201ENST00000503299 758 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MSH5O43196 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MSH5O43196 AP000720.1-201ENST00000625091 483 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
MSH5O43196 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MSH5O43196 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MSH5O43196 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MSH5O43196 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MSH5O43196 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MSH5O43196 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MSH5O43196 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MSH5O43196 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MSH5O43196 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MSH5O43196 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MSH5O43196 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MSH5O43196 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MSH5O43196 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MSH5O43196 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MSH5O43196 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MSH5O43196 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MSH5O43196 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MSH5O43196 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms