Protein–RNA interactions for Protein: O15078

CEP290, Centrosomal protein of 290 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 2,479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP290O15078 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CEP290O15078 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CEP290O15078 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CEP290O15078 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CEP290O15078 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
CEP290O15078 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CEP290O15078 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
CEP290O15078 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CEP290O15078 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
CEP290O15078 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CEP290O15078 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CEP290O15078 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
CEP290O15078 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CEP290O15078 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CEP290O15078 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CEP290O15078 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CEP290O15078 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CEP290O15078 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CEP290O15078 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CEP290O15078 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CEP290O15078 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CEP290O15078 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CEP290O15078 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CEP290O15078 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CEP290O15078 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CEP290O15078 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CEP290O15078 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CEP290O15078 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CEP290O15078 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CEP290O15078 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CEP290O15078 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CEP290O15078 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CEP290O15078 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CEP290O15078 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CEP290O15078 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CEP290O15078 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CEP290O15078 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CEP290O15078 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CEP290O15078 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CEP290O15078 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CEP290O15078 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CEP290O15078 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CEP290O15078 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CEP290O15078 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CEP290O15078 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CEP290O15078 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CEP290O15078 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CEP290O15078 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CEP290O15078 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CEP290O15078 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CEP290O15078 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CEP290O15078 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CEP290O15078 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CEP290O15078 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CEP290O15078 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CEP290O15078 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CEP290O15078 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CEP290O15078 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CEP290O15078 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CEP290O15078 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CEP290O15078 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CEP290O15078 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CEP290O15078 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CEP290O15078 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CEP290O15078 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CEP290O15078 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CEP290O15078 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CEP290O15078 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CEP290O15078 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CEP290O15078 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CEP290O15078 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
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CEP290O15078 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CEP290O15078 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CEP290O15078 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CEP290O15078 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CEP290O15078 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CEP290O15078 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CEP290O15078 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CEP290O15078 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CEP290O15078 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CEP290O15078 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CEP290O15078 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CEP290O15078 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CEP290O15078 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CEP290O15078 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CEP290O15078 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CEP290O15078 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CEP290O15078 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CEP290O15078 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CEP290O15078 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CEP290O15078 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CEP290O15078 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CEP290O15078 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CEP290O15078 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CEP290O15078 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CEP290O15078 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CEP290O15078 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
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