Protein–RNA interactions for Protein: O15013

ARHGEF10, Rho guanine nucleotide exchange factor 10, humanhuman

Predictions only

Length 1,369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF10O15013 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ARHGEF10O15013 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ARHGEF10O15013 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ARHGEF10O15013 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ARHGEF10O15013 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ARHGEF10O15013 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ARHGEF10O15013 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ARHGEF10O15013 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ARHGEF10O15013 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ARHGEF10O15013 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
ARHGEF10O15013 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ARHGEF10O15013 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ARHGEF10O15013 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ARHGEF10O15013 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ARHGEF10O15013 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ARHGEF10O15013 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ARHGEF10O15013 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ARHGEF10O15013 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ARHGEF10O15013 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ARHGEF10O15013 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ARHGEF10O15013 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
ARHGEF10O15013 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ARHGEF10O15013 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ARHGEF10O15013 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ARHGEF10O15013 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
ARHGEF10O15013 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ARHGEF10O15013 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
ARHGEF10O15013 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ARHGEF10O15013 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
ARHGEF10O15013 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ARHGEF10O15013 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
ARHGEF10O15013 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ARHGEF10O15013 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ARHGEF10O15013 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ARHGEF10O15013 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ARHGEF10O15013 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ARHGEF10O15013 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
ARHGEF10O15013 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ARHGEF10O15013 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ARHGEF10O15013 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ARHGEF10O15013 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ARHGEF10O15013 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ARHGEF10O15013 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ARHGEF10O15013 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ARHGEF10O15013 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ARHGEF10O15013 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ARHGEF10O15013 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ARHGEF10O15013 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ARHGEF10O15013 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ARHGEF10O15013 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ARHGEF10O15013 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ARHGEF10O15013 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ARHGEF10O15013 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ARHGEF10O15013 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ARHGEF10O15013 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ARHGEF10O15013 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ARHGEF10O15013 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ARHGEF10O15013 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ARHGEF10O15013 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ARHGEF10O15013 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ARHGEF10O15013 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ARHGEF10O15013 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ARHGEF10O15013 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ARHGEF10O15013 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ARHGEF10O15013 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ARHGEF10O15013 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ARHGEF10O15013 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ARHGEF10O15013 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ARHGEF10O15013 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ARHGEF10O15013 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ARHGEF10O15013 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ARHGEF10O15013 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ARHGEF10O15013 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ARHGEF10O15013 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ARHGEF10O15013 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ARHGEF10O15013 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ARHGEF10O15013 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ARHGEF10O15013 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ARHGEF10O15013 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ARHGEF10O15013 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ARHGEF10O15013 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ARHGEF10O15013 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
ARHGEF10O15013 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ARHGEF10O15013 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ARHGEF10O15013 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ARHGEF10O15013 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ARHGEF10O15013 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ARHGEF10O15013 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ARHGEF10O15013 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ARHGEF10O15013 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
ARHGEF10O15013 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ARHGEF10O15013 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ARHGEF10O15013 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ARHGEF10O15013 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ARHGEF10O15013 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ARHGEF10O15013 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ARHGEF10O15013 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ARHGEF10O15013 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ARHGEF10O15013 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ARHGEF10O15013 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
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