Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NEDD8-MDP1E9PL57 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NEDD8-MDP1E9PL57 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NEDD8-MDP1E9PL57 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NEDD8-MDP1E9PL57 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NEDD8-MDP1E9PL57 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NEDD8-MDP1E9PL57 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NEDD8-MDP1E9PL57 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NEDD8-MDP1E9PL57 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NEDD8-MDP1E9PL57 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NEDD8-MDP1E9PL57 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NEDD8-MDP1E9PL57 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NEDD8-MDP1E9PL57 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NEDD8-MDP1E9PL57 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NEDD8-MDP1E9PL57 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NEDD8-MDP1E9PL57 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NEDD8-MDP1E9PL57 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NEDD8-MDP1E9PL57 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NEDD8-MDP1E9PL57 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NEDD8-MDP1E9PL57 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
NEDD8-MDP1E9PL57 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NEDD8-MDP1E9PL57 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
NEDD8-MDP1E9PL57 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NEDD8-MDP1E9PL57 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NEDD8-MDP1E9PL57 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NEDD8-MDP1E9PL57 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NEDD8-MDP1E9PL57 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NEDD8-MDP1E9PL57 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NEDD8-MDP1E9PL57 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NEDD8-MDP1E9PL57 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
NEDD8-MDP1E9PL57 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NEDD8-MDP1E9PL57 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NEDD8-MDP1E9PL57 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NEDD8-MDP1E9PL57 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NEDD8-MDP1E9PL57 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NEDD8-MDP1E9PL57 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NEDD8-MDP1E9PL57 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NEDD8-MDP1E9PL57 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NEDD8-MDP1E9PL57 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NEDD8-MDP1E9PL57 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NEDD8-MDP1E9PL57 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NEDD8-MDP1E9PL57 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NEDD8-MDP1E9PL57 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NEDD8-MDP1E9PL57 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NEDD8-MDP1E9PL57 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NEDD8-MDP1E9PL57 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NEDD8-MDP1E9PL57 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NEDD8-MDP1E9PL57 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NEDD8-MDP1E9PL57 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NEDD8-MDP1E9PL57 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NEDD8-MDP1E9PL57 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NEDD8-MDP1E9PL57 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NEDD8-MDP1E9PL57 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NEDD8-MDP1E9PL57 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NEDD8-MDP1E9PL57 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
NEDD8-MDP1E9PL57 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NEDD8-MDP1E9PL57 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NEDD8-MDP1E9PL57 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NEDD8-MDP1E9PL57 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
NEDD8-MDP1E9PL57 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NEDD8-MDP1E9PL57 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NEDD8-MDP1E9PL57 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NEDD8-MDP1E9PL57 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NEDD8-MDP1E9PL57 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NEDD8-MDP1E9PL57 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NEDD8-MDP1E9PL57 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NEDD8-MDP1E9PL57 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NEDD8-MDP1E9PL57 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NEDD8-MDP1E9PL57 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NEDD8-MDP1E9PL57 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NEDD8-MDP1E9PL57 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
NEDD8-MDP1E9PL57 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NEDD8-MDP1E9PL57 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NEDD8-MDP1E9PL57 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NEDD8-MDP1E9PL57 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NEDD8-MDP1E9PL57 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NEDD8-MDP1E9PL57 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NEDD8-MDP1E9PL57 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NEDD8-MDP1E9PL57 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NEDD8-MDP1E9PL57 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NEDD8-MDP1E9PL57 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NEDD8-MDP1E9PL57 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NEDD8-MDP1E9PL57 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NEDD8-MDP1E9PL57 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NEDD8-MDP1E9PL57 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NEDD8-MDP1E9PL57 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NEDD8-MDP1E9PL57 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NEDD8-MDP1E9PL57 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NEDD8-MDP1E9PL57 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NEDD8-MDP1E9PL57 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
NEDD8-MDP1E9PL57 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms