Protein–RNA interactions for Protein: C9JVW0

INAFM1, Putative transmembrane protein INAFM1, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INAFM1C9JVW0 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
INAFM1C9JVW0 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
INAFM1C9JVW0 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC15.07■□□□□ 0
INAFM1C9JVW0 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
INAFM1C9JVW0 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
INAFM1C9JVW0 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
INAFM1C9JVW0 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
INAFM1C9JVW0 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
INAFM1C9JVW0 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
INAFM1C9JVW0 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
INAFM1C9JVW0 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
INAFM1C9JVW0 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
INAFM1C9JVW0 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC15.07■□□□□ 0
INAFM1C9JVW0 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC15.07■□□□□ 0
INAFM1C9JVW0 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
INAFM1C9JVW0 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
INAFM1C9JVW0 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
INAFM1C9JVW0 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
INAFM1C9JVW0 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
INAFM1C9JVW0 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
INAFM1C9JVW0 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
INAFM1C9JVW0 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC15.06■□□□□ 0
INAFM1C9JVW0 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
INAFM1C9JVW0 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
INAFM1C9JVW0 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
INAFM1C9JVW0 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
INAFM1C9JVW0 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
INAFM1C9JVW0 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
INAFM1C9JVW0 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
INAFM1C9JVW0 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
INAFM1C9JVW0 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
INAFM1C9JVW0 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC15.06■□□□□ 0
INAFM1C9JVW0 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
INAFM1C9JVW0 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
INAFM1C9JVW0 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC15.06■□□□□ 0
INAFM1C9JVW0 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
INAFM1C9JVW0 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
INAFM1C9JVW0 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
INAFM1C9JVW0 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
INAFM1C9JVW0 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC15.06■□□□□ 0
INAFM1C9JVW0 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC15.06■□□□□ 0
INAFM1C9JVW0 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
INAFM1C9JVW0 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
INAFM1C9JVW0 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
INAFM1C9JVW0 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
INAFM1C9JVW0 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
INAFM1C9JVW0 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
INAFM1C9JVW0 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
INAFM1C9JVW0 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC15.05■□□□□ 0
INAFM1C9JVW0 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
INAFM1C9JVW0 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
INAFM1C9JVW0 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
INAFM1C9JVW0 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
INAFM1C9JVW0 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
INAFM1C9JVW0 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
INAFM1C9JVW0 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC15.05■□□□□ -0
INAFM1C9JVW0 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC15.05■□□□□ -0
INAFM1C9JVW0 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
INAFM1C9JVW0 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
INAFM1C9JVW0 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC15.05■□□□□ -0
INAFM1C9JVW0 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
INAFM1C9JVW0 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
INAFM1C9JVW0 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
INAFM1C9JVW0 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
INAFM1C9JVW0 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
INAFM1C9JVW0 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
INAFM1C9JVW0 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
INAFM1C9JVW0 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
INAFM1C9JVW0 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
INAFM1C9JVW0 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
INAFM1C9JVW0 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
INAFM1C9JVW0 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
INAFM1C9JVW0 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
INAFM1C9JVW0 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
INAFM1C9JVW0 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
INAFM1C9JVW0 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
INAFM1C9JVW0 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
INAFM1C9JVW0 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
INAFM1C9JVW0 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
INAFM1C9JVW0 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
INAFM1C9JVW0 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
INAFM1C9JVW0 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
INAFM1C9JVW0 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
INAFM1C9JVW0 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC15.04■□□□□ -0
INAFM1C9JVW0 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
INAFM1C9JVW0 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
INAFM1C9JVW0 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
INAFM1C9JVW0 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
INAFM1C9JVW0 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC15.04■□□□□ -0
INAFM1C9JVW0 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC15.04■□□□□ -0
INAFM1C9JVW0 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
INAFM1C9JVW0 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
INAFM1C9JVW0 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
INAFM1C9JVW0 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
INAFM1C9JVW0 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
INAFM1C9JVW0 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
INAFM1C9JVW0 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
INAFM1C9JVW0 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
INAFM1C9JVW0 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
INAFM1C9JVW0 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms