Protein–RNA interactions for Protein: C9JBD0

KRBOX1, KRAB domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRBOX1C9JBD0 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRBOX1C9JBD0 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRBOX1C9JBD0 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRBOX1C9JBD0 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRBOX1C9JBD0 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRBOX1C9JBD0 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRBOX1C9JBD0 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRBOX1C9JBD0 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRBOX1C9JBD0 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRBOX1C9JBD0 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRBOX1C9JBD0 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRBOX1C9JBD0 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRBOX1C9JBD0 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRBOX1C9JBD0 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRBOX1C9JBD0 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRBOX1C9JBD0 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRBOX1C9JBD0 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRBOX1C9JBD0 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRBOX1C9JBD0 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRBOX1C9JBD0 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRBOX1C9JBD0 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
KRBOX1C9JBD0 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRBOX1C9JBD0 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRBOX1C9JBD0 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRBOX1C9JBD0 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRBOX1C9JBD0 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRBOX1C9JBD0 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRBOX1C9JBD0 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRBOX1C9JBD0 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRBOX1C9JBD0 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRBOX1C9JBD0 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRBOX1C9JBD0 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRBOX1C9JBD0 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRBOX1C9JBD0 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRBOX1C9JBD0 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRBOX1C9JBD0 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRBOX1C9JBD0 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRBOX1C9JBD0 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KRBOX1C9JBD0 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KRBOX1C9JBD0 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KRBOX1C9JBD0 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KRBOX1C9JBD0 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KRBOX1C9JBD0 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KRBOX1C9JBD0 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KRBOX1C9JBD0 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KRBOX1C9JBD0 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KRBOX1C9JBD0 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KRBOX1C9JBD0 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KRBOX1C9JBD0 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KRBOX1C9JBD0 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KRBOX1C9JBD0 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
KRBOX1C9JBD0 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KRBOX1C9JBD0 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KRBOX1C9JBD0 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KRBOX1C9JBD0 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KRBOX1C9JBD0 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KRBOX1C9JBD0 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KRBOX1C9JBD0 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KRBOX1C9JBD0 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KRBOX1C9JBD0 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KRBOX1C9JBD0 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KRBOX1C9JBD0 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KRBOX1C9JBD0 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KRBOX1C9JBD0 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KRBOX1C9JBD0 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KRBOX1C9JBD0 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KRBOX1C9JBD0 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KRBOX1C9JBD0 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KRBOX1C9JBD0 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KRBOX1C9JBD0 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KRBOX1C9JBD0 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KRBOX1C9JBD0 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KRBOX1C9JBD0 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KRBOX1C9JBD0 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KRBOX1C9JBD0 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KRBOX1C9JBD0 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KRBOX1C9JBD0 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KRBOX1C9JBD0 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KRBOX1C9JBD0 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KRBOX1C9JBD0 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KRBOX1C9JBD0 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KRBOX1C9JBD0 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KRBOX1C9JBD0 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KRBOX1C9JBD0 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KRBOX1C9JBD0 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KRBOX1C9JBD0 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KRBOX1C9JBD0 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KRBOX1C9JBD0 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KRBOX1C9JBD0 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KRBOX1C9JBD0 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KRBOX1C9JBD0 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KRBOX1C9JBD0 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
KRBOX1C9JBD0 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KRBOX1C9JBD0 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KRBOX1C9JBD0 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
KRBOX1C9JBD0 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KRBOX1C9JBD0 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KRBOX1C9JBD0 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KRBOX1C9JBD0 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KRBOX1C9JBD0 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms