Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HMGB1P1B2RPK0 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HMGB1P1B2RPK0 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HMGB1P1B2RPK0 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
HMGB1P1B2RPK0 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HMGB1P1B2RPK0 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HMGB1P1B2RPK0 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HMGB1P1B2RPK0 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HMGB1P1B2RPK0 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HMGB1P1B2RPK0 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HMGB1P1B2RPK0 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
HMGB1P1B2RPK0 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HMGB1P1B2RPK0 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HMGB1P1B2RPK0 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HMGB1P1B2RPK0 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HMGB1P1B2RPK0 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
HMGB1P1B2RPK0 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HMGB1P1B2RPK0 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HMGB1P1B2RPK0 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HMGB1P1B2RPK0 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HMGB1P1B2RPK0 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HMGB1P1B2RPK0 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HMGB1P1B2RPK0 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HMGB1P1B2RPK0 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HMGB1P1B2RPK0 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HMGB1P1B2RPK0 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HMGB1P1B2RPK0 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HMGB1P1B2RPK0 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HMGB1P1B2RPK0 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
HMGB1P1B2RPK0 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HMGB1P1B2RPK0 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HMGB1P1B2RPK0 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HMGB1P1B2RPK0 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HMGB1P1B2RPK0 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HMGB1P1B2RPK0 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HMGB1P1B2RPK0 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HMGB1P1B2RPK0 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HMGB1P1B2RPK0 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HMGB1P1B2RPK0 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HMGB1P1B2RPK0 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HMGB1P1B2RPK0 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HMGB1P1B2RPK0 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HMGB1P1B2RPK0 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
HMGB1P1B2RPK0 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HMGB1P1B2RPK0 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HMGB1P1B2RPK0 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HMGB1P1B2RPK0 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HMGB1P1B2RPK0 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HMGB1P1B2RPK0 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HMGB1P1B2RPK0 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HMGB1P1B2RPK0 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HMGB1P1B2RPK0 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HMGB1P1B2RPK0 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HMGB1P1B2RPK0 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HMGB1P1B2RPK0 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HMGB1P1B2RPK0 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HMGB1P1B2RPK0 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
HMGB1P1B2RPK0 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HMGB1P1B2RPK0 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HMGB1P1B2RPK0 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HMGB1P1B2RPK0 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HMGB1P1B2RPK0 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HMGB1P1B2RPK0 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HMGB1P1B2RPK0 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HMGB1P1B2RPK0 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HMGB1P1B2RPK0 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
HMGB1P1B2RPK0 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HMGB1P1B2RPK0 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HMGB1P1B2RPK0 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HMGB1P1B2RPK0 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HMGB1P1B2RPK0 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HMGB1P1B2RPK0 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HMGB1P1B2RPK0 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HMGB1P1B2RPK0 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HMGB1P1B2RPK0 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HMGB1P1B2RPK0 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HMGB1P1B2RPK0 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HMGB1P1B2RPK0 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HMGB1P1B2RPK0 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HMGB1P1B2RPK0 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HMGB1P1B2RPK0 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
HMGB1P1B2RPK0 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HMGB1P1B2RPK0 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HMGB1P1B2RPK0 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HMGB1P1B2RPK0 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HMGB1P1B2RPK0 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HMGB1P1B2RPK0 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HMGB1P1B2RPK0 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HMGB1P1B2RPK0 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HMGB1P1B2RPK0 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HMGB1P1B2RPK0 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HMGB1P1B2RPK0 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HMGB1P1B2RPK0 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HMGB1P1B2RPK0 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HMGB1P1B2RPK0 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HMGB1P1B2RPK0 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HMGB1P1B2RPK0 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HMGB1P1B2RPK0 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HMGB1P1B2RPK0 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HMGB1P1B2RPK0 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms