Protein–RNA interactions for Protein: A6NEF3

GOLGA6L4, Golgin subfamily A member 6-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L4A6NEF3 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GOLGA6L4A6NEF3 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GOLGA6L4A6NEF3 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
GOLGA6L4A6NEF3 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
GOLGA6L4A6NEF3 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GOLGA6L4A6NEF3 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GOLGA6L4A6NEF3 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GOLGA6L4A6NEF3 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GOLGA6L4A6NEF3 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GOLGA6L4A6NEF3 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GOLGA6L4A6NEF3 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GOLGA6L4A6NEF3 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GOLGA6L4A6NEF3 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GOLGA6L4A6NEF3 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GOLGA6L4A6NEF3 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GOLGA6L4A6NEF3 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GOLGA6L4A6NEF3 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GOLGA6L4A6NEF3 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GOLGA6L4A6NEF3 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
GOLGA6L4A6NEF3 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GOLGA6L4A6NEF3 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GOLGA6L4A6NEF3 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GOLGA6L4A6NEF3 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GOLGA6L4A6NEF3 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GOLGA6L4A6NEF3 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GOLGA6L4A6NEF3 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GOLGA6L4A6NEF3 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GOLGA6L4A6NEF3 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GOLGA6L4A6NEF3 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GOLGA6L4A6NEF3 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GOLGA6L4A6NEF3 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GOLGA6L4A6NEF3 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GOLGA6L4A6NEF3 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GOLGA6L4A6NEF3 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GOLGA6L4A6NEF3 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GOLGA6L4A6NEF3 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GOLGA6L4A6NEF3 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GOLGA6L4A6NEF3 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GOLGA6L4A6NEF3 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GOLGA6L4A6NEF3 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GOLGA6L4A6NEF3 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GOLGA6L4A6NEF3 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GOLGA6L4A6NEF3 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GOLGA6L4A6NEF3 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GOLGA6L4A6NEF3 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GOLGA6L4A6NEF3 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GOLGA6L4A6NEF3 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
GOLGA6L4A6NEF3 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GOLGA6L4A6NEF3 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GOLGA6L4A6NEF3 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GOLGA6L4A6NEF3 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GOLGA6L4A6NEF3 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GOLGA6L4A6NEF3 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GOLGA6L4A6NEF3 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
GOLGA6L4A6NEF3 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
GOLGA6L4A6NEF3 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GOLGA6L4A6NEF3 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GOLGA6L4A6NEF3 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GOLGA6L4A6NEF3 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GOLGA6L4A6NEF3 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GOLGA6L4A6NEF3 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GOLGA6L4A6NEF3 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GOLGA6L4A6NEF3 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GOLGA6L4A6NEF3 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GOLGA6L4A6NEF3 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GOLGA6L4A6NEF3 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GOLGA6L4A6NEF3 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GOLGA6L4A6NEF3 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GOLGA6L4A6NEF3 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GOLGA6L4A6NEF3 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GOLGA6L4A6NEF3 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GOLGA6L4A6NEF3 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GOLGA6L4A6NEF3 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GOLGA6L4A6NEF3 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GOLGA6L4A6NEF3 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GOLGA6L4A6NEF3 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GOLGA6L4A6NEF3 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GOLGA6L4A6NEF3 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GOLGA6L4A6NEF3 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GOLGA6L4A6NEF3 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GOLGA6L4A6NEF3 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GOLGA6L4A6NEF3 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GOLGA6L4A6NEF3 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GOLGA6L4A6NEF3 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GOLGA6L4A6NEF3 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GOLGA6L4A6NEF3 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GOLGA6L4A6NEF3 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GOLGA6L4A6NEF3 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GOLGA6L4A6NEF3 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GOLGA6L4A6NEF3 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GOLGA6L4A6NEF3 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GOLGA6L4A6NEF3 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GOLGA6L4A6NEF3 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GOLGA6L4A6NEF3 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GOLGA6L4A6NEF3 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GOLGA6L4A6NEF3 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GOLGA6L4A6NEF3 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms