Protein–RNA interactions for Protein: A6NDU8

C5orf51, UPF0600 protein C5orf51, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf51A6NDU8 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C5orf51A6NDU8 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C5orf51A6NDU8 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C5orf51A6NDU8 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C5orf51A6NDU8 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C5orf51A6NDU8 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C5orf51A6NDU8 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C5orf51A6NDU8 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C5orf51A6NDU8 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C5orf51A6NDU8 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C5orf51A6NDU8 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C5orf51A6NDU8 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C5orf51A6NDU8 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C5orf51A6NDU8 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C5orf51A6NDU8 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
C5orf51A6NDU8 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C5orf51A6NDU8 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C5orf51A6NDU8 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C5orf51A6NDU8 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C5orf51A6NDU8 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
C5orf51A6NDU8 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C5orf51A6NDU8 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
C5orf51A6NDU8 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C5orf51A6NDU8 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
C5orf51A6NDU8 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C5orf51A6NDU8 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
C5orf51A6NDU8 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C5orf51A6NDU8 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C5orf51A6NDU8 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C5orf51A6NDU8 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C5orf51A6NDU8 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C5orf51A6NDU8 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C5orf51A6NDU8 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C5orf51A6NDU8 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C5orf51A6NDU8 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C5orf51A6NDU8 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
C5orf51A6NDU8 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C5orf51A6NDU8 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C5orf51A6NDU8 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C5orf51A6NDU8 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C5orf51A6NDU8 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C5orf51A6NDU8 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C5orf51A6NDU8 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C5orf51A6NDU8 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C5orf51A6NDU8 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C5orf51A6NDU8 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
C5orf51A6NDU8 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C5orf51A6NDU8 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C5orf51A6NDU8 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C5orf51A6NDU8 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C5orf51A6NDU8 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C5orf51A6NDU8 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C5orf51A6NDU8 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C5orf51A6NDU8 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C5orf51A6NDU8 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C5orf51A6NDU8 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C5orf51A6NDU8 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C5orf51A6NDU8 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C5orf51A6NDU8 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C5orf51A6NDU8 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C5orf51A6NDU8 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C5orf51A6NDU8 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C5orf51A6NDU8 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
C5orf51A6NDU8 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C5orf51A6NDU8 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C5orf51A6NDU8 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C5orf51A6NDU8 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C5orf51A6NDU8 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C5orf51A6NDU8 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C5orf51A6NDU8 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
C5orf51A6NDU8 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
C5orf51A6NDU8 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
C5orf51A6NDU8 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
C5orf51A6NDU8 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
C5orf51A6NDU8 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
C5orf51A6NDU8 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
C5orf51A6NDU8 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
C5orf51A6NDU8 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
C5orf51A6NDU8 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C5orf51A6NDU8 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C5orf51A6NDU8 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C5orf51A6NDU8 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C5orf51A6NDU8 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C5orf51A6NDU8 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C5orf51A6NDU8 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C5orf51A6NDU8 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C5orf51A6NDU8 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C5orf51A6NDU8 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
C5orf51A6NDU8 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
C5orf51A6NDU8 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
C5orf51A6NDU8 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
C5orf51A6NDU8 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C5orf51A6NDU8 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C5orf51A6NDU8 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
C5orf51A6NDU8 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
C5orf51A6NDU8 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C5orf51A6NDU8 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C5orf51A6NDU8 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C5orf51A6NDU8 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
C5orf51A6NDU8 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms