Protein–RNA interactions for Protein: A4D1E1

ZNF804B, Zinc finger protein 804B, humanhuman

Predictions only

Length 1,349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF804BA4D1E1 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF804BA4D1E1 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF804BA4D1E1 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF804BA4D1E1 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF804BA4D1E1 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF804BA4D1E1 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF804BA4D1E1 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF804BA4D1E1 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF804BA4D1E1 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF804BA4D1E1 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF804BA4D1E1 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF804BA4D1E1 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF804BA4D1E1 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF804BA4D1E1 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF804BA4D1E1 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF804BA4D1E1 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF804BA4D1E1 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF804BA4D1E1 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF804BA4D1E1 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF804BA4D1E1 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF804BA4D1E1 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF804BA4D1E1 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF804BA4D1E1 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF804BA4D1E1 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF804BA4D1E1 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF804BA4D1E1 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF804BA4D1E1 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF804BA4D1E1 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF804BA4D1E1 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF804BA4D1E1 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF804BA4D1E1 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF804BA4D1E1 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF804BA4D1E1 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF804BA4D1E1 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF804BA4D1E1 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF804BA4D1E1 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF804BA4D1E1 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF804BA4D1E1 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF804BA4D1E1 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF804BA4D1E1 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF804BA4D1E1 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF804BA4D1E1 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF804BA4D1E1 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF804BA4D1E1 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF804BA4D1E1 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF804BA4D1E1 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF804BA4D1E1 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF804BA4D1E1 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF804BA4D1E1 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF804BA4D1E1 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF804BA4D1E1 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF804BA4D1E1 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF804BA4D1E1 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF804BA4D1E1 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF804BA4D1E1 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF804BA4D1E1 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF804BA4D1E1 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF804BA4D1E1 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF804BA4D1E1 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF804BA4D1E1 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF804BA4D1E1 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF804BA4D1E1 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF804BA4D1E1 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF804BA4D1E1 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF804BA4D1E1 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF804BA4D1E1 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF804BA4D1E1 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF804BA4D1E1 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF804BA4D1E1 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF804BA4D1E1 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF804BA4D1E1 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF804BA4D1E1 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF804BA4D1E1 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF804BA4D1E1 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF804BA4D1E1 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF804BA4D1E1 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF804BA4D1E1 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF804BA4D1E1 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF804BA4D1E1 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF804BA4D1E1 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF804BA4D1E1 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF804BA4D1E1 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ZNF804BA4D1E1 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF804BA4D1E1 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF804BA4D1E1 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF804BA4D1E1 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF804BA4D1E1 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF804BA4D1E1 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF804BA4D1E1 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF804BA4D1E1 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF804BA4D1E1 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF804BA4D1E1 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF804BA4D1E1 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF804BA4D1E1 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF804BA4D1E1 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF804BA4D1E1 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF804BA4D1E1 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF804BA4D1E1 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF804BA4D1E1 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF804BA4D1E1 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms