Protein–RNA interactions for Protein: A0A0D9SFI3

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0D9SFI3 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
A0A0D9SFI3 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
A0A0D9SFI3 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
A0A0D9SFI3 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
A0A0D9SFI3 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
A0A0D9SFI3 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
A0A0D9SFI3 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
A0A0D9SFI3 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
A0A0D9SFI3 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
A0A0D9SFI3 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
A0A0D9SFI3 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
A0A0D9SFI3 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
A0A0D9SFI3 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
A0A0D9SFI3 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
A0A0D9SFI3 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
A0A0D9SFI3 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
A0A0D9SFI3 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
A0A0D9SFI3 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
A0A0D9SFI3 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
A0A0D9SFI3 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
A0A0D9SFI3 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
A0A0D9SFI3 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
A0A0D9SFI3 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
A0A0D9SFI3 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
A0A0D9SFI3 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
A0A0D9SFI3 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
A0A0D9SFI3 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
A0A0D9SFI3 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
A0A0D9SFI3 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
A0A0D9SFI3 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
A0A0D9SFI3 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
A0A0D9SFI3 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
A0A0D9SFI3 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
A0A0D9SFI3 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
A0A0D9SFI3 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
A0A0D9SFI3 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
A0A0D9SFI3 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
A0A0D9SFI3 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
A0A0D9SFI3 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
A0A0D9SFI3 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
A0A0D9SFI3 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
A0A0D9SFI3 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
A0A0D9SFI3 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
A0A0D9SFI3 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
A0A0D9SFI3 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
A0A0D9SFI3 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
A0A0D9SFI3 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
A0A0D9SFI3 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
A0A0D9SFI3 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
A0A0D9SFI3 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
A0A0D9SFI3 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
A0A0D9SFI3 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
A0A0D9SFI3 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
A0A0D9SFI3 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
A0A0D9SFI3 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A0D9SFI3 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A0D9SFI3 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A0D9SFI3 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A0D9SFI3 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A0D9SFI3 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A0D9SFI3 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A0D9SFI3 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A0D9SFI3 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A0D9SFI3 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A0D9SFI3 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A0D9SFI3 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A0D9SFI3 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A0D9SFI3 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A0D9SFI3 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A0D9SFI3 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A0D9SFI3 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A0D9SFI3 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A0D9SFI3 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A0D9SFI3 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A0D9SFI3 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A0D9SFI3 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A0D9SFI3 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A0D9SFI3 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A0D9SFI3 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A0D9SFI3 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A0D9SFI3 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A0D9SFI3 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A0D9SFI3 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A0D9SFI3 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A0D9SFI3 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A0D9SFI3 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A0D9SFI3 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A0D9SFI3 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A0D9SFI3 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A0D9SFI3 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A0D9SFI3 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A0D9SFI3 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A0D9SFI3 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A0D9SFI3 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A0D9SFI3 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A0D9SFI3 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A0D9SFI3 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A0D9SFI3 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A0D9SFI3 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
A0A0D9SFI3 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms