Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B6S5

IGKV1-27, Immunoglobulin kappa variable 1-27, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV1-27A0A075B6S5 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IGKV1-27A0A075B6S5 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IGKV1-27A0A075B6S5 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IGKV1-27A0A075B6S5 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IGKV1-27A0A075B6S5 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IGKV1-27A0A075B6S5 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IGKV1-27A0A075B6S5 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IGKV1-27A0A075B6S5 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IGKV1-27A0A075B6S5 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IGKV1-27A0A075B6S5 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
IGKV1-27A0A075B6S5 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
IGKV1-27A0A075B6S5 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
IGKV1-27A0A075B6S5 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IGKV1-27A0A075B6S5 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IGKV1-27A0A075B6S5 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IGKV1-27A0A075B6S5 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IGKV1-27A0A075B6S5 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IGKV1-27A0A075B6S5 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IGKV1-27A0A075B6S5 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IGKV1-27A0A075B6S5 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
IGKV1-27A0A075B6S5 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
IGKV1-27A0A075B6S5 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
IGKV1-27A0A075B6S5 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
IGKV1-27A0A075B6S5 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
IGKV1-27A0A075B6S5 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
IGKV1-27A0A075B6S5 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
IGKV1-27A0A075B6S5 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
IGKV1-27A0A075B6S5 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
IGKV1-27A0A075B6S5 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
IGKV1-27A0A075B6S5 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
IGKV1-27A0A075B6S5 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
IGKV1-27A0A075B6S5 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGKV1-27A0A075B6S5 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGKV1-27A0A075B6S5 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGKV1-27A0A075B6S5 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGKV1-27A0A075B6S5 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGKV1-27A0A075B6S5 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
IGKV1-27A0A075B6S5 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGKV1-27A0A075B6S5 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGKV1-27A0A075B6S5 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGKV1-27A0A075B6S5 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGKV1-27A0A075B6S5 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGKV1-27A0A075B6S5 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGKV1-27A0A075B6S5 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGKV1-27A0A075B6S5 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGKV1-27A0A075B6S5 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGKV1-27A0A075B6S5 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
IGKV1-27A0A075B6S5 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGKV1-27A0A075B6S5 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGKV1-27A0A075B6S5 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGKV1-27A0A075B6S5 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGKV1-27A0A075B6S5 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGKV1-27A0A075B6S5 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGKV1-27A0A075B6S5 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGKV1-27A0A075B6S5 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGKV1-27A0A075B6S5 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGKV1-27A0A075B6S5 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGKV1-27A0A075B6S5 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGKV1-27A0A075B6S5 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGKV1-27A0A075B6S5 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IGKV1-27A0A075B6S5 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IGKV1-27A0A075B6S5 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
IGKV1-27A0A075B6S5 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
IGKV1-27A0A075B6S5 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IGKV1-27A0A075B6S5 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IGKV1-27A0A075B6S5 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IGKV1-27A0A075B6S5 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IGKV1-27A0A075B6S5 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
IGKV1-27A0A075B6S5 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IGKV1-27A0A075B6S5 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
IGKV1-27A0A075B6S5 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IGKV1-27A0A075B6S5 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
IGKV1-27A0A075B6S5 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IGKV1-27A0A075B6S5 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IGKV1-27A0A075B6S5 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
IGKV1-27A0A075B6S5 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
IGKV1-27A0A075B6S5 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
IGKV1-27A0A075B6S5 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
IGKV1-27A0A075B6S5 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
IGKV1-27A0A075B6S5 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IGKV1-27A0A075B6S5 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IGKV1-27A0A075B6S5 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IGKV1-27A0A075B6S5 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
IGKV1-27A0A075B6S5 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IGKV1-27A0A075B6S5 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IGKV1-27A0A075B6S5 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
IGKV1-27A0A075B6S5 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
IGKV1-27A0A075B6S5 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IGKV1-27A0A075B6S5 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IGKV1-27A0A075B6S5 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IGKV1-27A0A075B6S5 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
IGKV1-27A0A075B6S5 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IGKV1-27A0A075B6S5 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IGKV1-27A0A075B6S5 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IGKV1-27A0A075B6S5 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IGKV1-27A0A075B6S5 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IGKV1-27A0A075B6S5 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IGKV1-27A0A075B6S5 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IGKV1-27A0A075B6S5 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IGKV1-27A0A075B6S5 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms