Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNX13Q9Y5W8 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNX13Q9Y5W8 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNX13Q9Y5W8 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNX13Q9Y5W8 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNX13Q9Y5W8 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNX13Q9Y5W8 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNX13Q9Y5W8 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNX13Q9Y5W8 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNX13Q9Y5W8 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNX13Q9Y5W8 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNX13Q9Y5W8 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
SNX13Q9Y5W8 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
SNX13Q9Y5W8 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNX13Q9Y5W8 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNX13Q9Y5W8 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNX13Q9Y5W8 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNX13Q9Y5W8 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNX13Q9Y5W8 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNX13Q9Y5W8 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNX13Q9Y5W8 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNX13Q9Y5W8 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNX13Q9Y5W8 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNX13Q9Y5W8 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNX13Q9Y5W8 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNX13Q9Y5W8 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
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SNX13Q9Y5W8 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNX13Q9Y5W8 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNX13Q9Y5W8 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SNX13Q9Y5W8 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNX13Q9Y5W8 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNX13Q9Y5W8 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNX13Q9Y5W8 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNX13Q9Y5W8 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNX13Q9Y5W8 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNX13Q9Y5W8 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNX13Q9Y5W8 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNX13Q9Y5W8 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNX13Q9Y5W8 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNX13Q9Y5W8 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNX13Q9Y5W8 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNX13Q9Y5W8 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNX13Q9Y5W8 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNX13Q9Y5W8 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNX13Q9Y5W8 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
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SNX13Q9Y5W8 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNX13Q9Y5W8 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNX13Q9Y5W8 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
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SNX13Q9Y5W8 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNX13Q9Y5W8 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNX13Q9Y5W8 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNX13Q9Y5W8 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNX13Q9Y5W8 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNX13Q9Y5W8 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNX13Q9Y5W8 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNX13Q9Y5W8 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNX13Q9Y5W8 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNX13Q9Y5W8 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNX13Q9Y5W8 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
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SNX13Q9Y5W8 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
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SNX13Q9Y5W8 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
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SNX13Q9Y5W8 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SNX13Q9Y5W8 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNX13Q9Y5W8 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNX13Q9Y5W8 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNX13Q9Y5W8 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNX13Q9Y5W8 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNX13Q9Y5W8 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNX13Q9Y5W8 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNX13Q9Y5W8 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNX13Q9Y5W8 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNX13Q9Y5W8 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNX13Q9Y5W8 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SNX13Q9Y5W8 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNX13Q9Y5W8 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNX13Q9Y5W8 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNX13Q9Y5W8 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNX13Q9Y5W8 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNX13Q9Y5W8 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNX13Q9Y5W8 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNX13Q9Y5W8 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNX13Q9Y5W8 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNX13Q9Y5W8 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNX13Q9Y5W8 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
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