Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4B6

DCAF1, DDB1- and CUL4-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF1Q9Y4B6 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
DCAF1Q9Y4B6 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.01■■■■□ 3.36
DCAF1Q9Y4B6 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
DCAF1Q9Y4B6 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
DCAF1Q9Y4B6 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
DCAF1Q9Y4B6 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
DCAF1Q9Y4B6 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
DCAF1Q9Y4B6 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
DCAF1Q9Y4B6 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.01■■■■□ 3.36
DCAF1Q9Y4B6 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC36.01■■■■□ 3.36
DCAF1Q9Y4B6 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
DCAF1Q9Y4B6 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC36.01■■■■□ 3.35
DCAF1Q9Y4B6 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
DCAF1Q9Y4B6 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
DCAF1Q9Y4B6 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
DCAF1Q9Y4B6 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
DCAF1Q9Y4B6 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36■■■■□ 3.35
DCAF1Q9Y4B6 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC36■■■■□ 3.35
DCAF1Q9Y4B6 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC36■■■■□ 3.35
DCAF1Q9Y4B6 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC36■■■■□ 3.35
DCAF1Q9Y4B6 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
DCAF1Q9Y4B6 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
DCAF1Q9Y4B6 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
DCAF1Q9Y4B6 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC36■■■■□ 3.35
DCAF1Q9Y4B6 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
DCAF1Q9Y4B6 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
DCAF1Q9Y4B6 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.99■■■■□ 3.35
DCAF1Q9Y4B6 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
DCAF1Q9Y4B6 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC35.99■■■■□ 3.35
DCAF1Q9Y4B6 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC35.99■■■■□ 3.35
DCAF1Q9Y4B6 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC35.99■■■■□ 3.35
DCAF1Q9Y4B6 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
DCAF1Q9Y4B6 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
DCAF1Q9Y4B6 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
DCAF1Q9Y4B6 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
DCAF1Q9Y4B6 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC35.98■■■■□ 3.35
DCAF1Q9Y4B6 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
DCAF1Q9Y4B6 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
DCAF1Q9Y4B6 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
DCAF1Q9Y4B6 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
DCAF1Q9Y4B6 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
DCAF1Q9Y4B6 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
DCAF1Q9Y4B6 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
DCAF1Q9Y4B6 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC35.98■■■■□ 3.35
DCAF1Q9Y4B6 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
DCAF1Q9Y4B6 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC35.98■■■■□ 3.35
DCAF1Q9Y4B6 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC35.98■■■■□ 3.35
DCAF1Q9Y4B6 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC35.98■■■■□ 3.35
DCAF1Q9Y4B6 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
DCAF1Q9Y4B6 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
DCAF1Q9Y4B6 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
DCAF1Q9Y4B6 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
DCAF1Q9Y4B6 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC35.97■■■■□ 3.35
DCAF1Q9Y4B6 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
DCAF1Q9Y4B6 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
DCAF1Q9Y4B6 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
DCAF1Q9Y4B6 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
DCAF1Q9Y4B6 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
DCAF1Q9Y4B6 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC35.97■■■■□ 3.35
DCAF1Q9Y4B6 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC35.97■■■■□ 3.35
DCAF1Q9Y4B6 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
DCAF1Q9Y4B6 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
DCAF1Q9Y4B6 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
DCAF1Q9Y4B6 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC35.97■■■■□ 3.35
DCAF1Q9Y4B6 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.96■■■■□ 3.35
DCAF1Q9Y4B6 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC35.96■■■■□ 3.35
DCAF1Q9Y4B6 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC35.96■■■■□ 3.35
DCAF1Q9Y4B6 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
DCAF1Q9Y4B6 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
DCAF1Q9Y4B6 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
DCAF1Q9Y4B6 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
DCAF1Q9Y4B6 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
DCAF1Q9Y4B6 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC35.96■■■■□ 3.35
DCAF1Q9Y4B6 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC35.96■■■■□ 3.35
DCAF1Q9Y4B6 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC35.96■■■■□ 3.35
DCAF1Q9Y4B6 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC35.96■■■■□ 3.35
DCAF1Q9Y4B6 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC35.96■■■■□ 3.35
DCAF1Q9Y4B6 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC35.96■■■■□ 3.35
DCAF1Q9Y4B6 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
DCAF1Q9Y4B6 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
DCAF1Q9Y4B6 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
DCAF1Q9Y4B6 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC35.95■■■■□ 3.35
DCAF1Q9Y4B6 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
DCAF1Q9Y4B6 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC35.95■■■■□ 3.35
DCAF1Q9Y4B6 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC35.95■■■■□ 3.35
DCAF1Q9Y4B6 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC35.95■■■■□ 3.35
DCAF1Q9Y4B6 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.95■■■■□ 3.35
DCAF1Q9Y4B6 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
DCAF1Q9Y4B6 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
DCAF1Q9Y4B6 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.34
DCAF1Q9Y4B6 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC35.94■■■■□ 3.34
DCAF1Q9Y4B6 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
DCAF1Q9Y4B6 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC35.94■■■■□ 3.34
DCAF1Q9Y4B6 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
DCAF1Q9Y4B6 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC35.94■■■■□ 3.34
DCAF1Q9Y4B6 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
DCAF1Q9Y4B6 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
DCAF1Q9Y4B6 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC35.93■■■■□ 3.34
DCAF1Q9Y4B6 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
DCAF1Q9Y4B6 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms