Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

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Length 701 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SH3BP1Q9Y3L3 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SH3BP1Q9Y3L3 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SH3BP1Q9Y3L3 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SH3BP1Q9Y3L3 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SH3BP1Q9Y3L3 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SH3BP1Q9Y3L3 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SH3BP1Q9Y3L3 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SH3BP1Q9Y3L3 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SH3BP1Q9Y3L3 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SH3BP1Q9Y3L3 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SH3BP1Q9Y3L3 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SH3BP1Q9Y3L3 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SH3BP1Q9Y3L3 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SH3BP1Q9Y3L3 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SH3BP1Q9Y3L3 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SH3BP1Q9Y3L3 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SH3BP1Q9Y3L3 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SH3BP1Q9Y3L3 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SH3BP1Q9Y3L3 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SH3BP1Q9Y3L3 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SH3BP1Q9Y3L3 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SH3BP1Q9Y3L3 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SH3BP1Q9Y3L3 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SH3BP1Q9Y3L3 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SH3BP1Q9Y3L3 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SH3BP1Q9Y3L3 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SH3BP1Q9Y3L3 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SH3BP1Q9Y3L3 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SH3BP1Q9Y3L3 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SH3BP1Q9Y3L3 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SH3BP1Q9Y3L3 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
SH3BP1Q9Y3L3 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SH3BP1Q9Y3L3 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SH3BP1Q9Y3L3 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SH3BP1Q9Y3L3 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SH3BP1Q9Y3L3 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SH3BP1Q9Y3L3 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SH3BP1Q9Y3L3 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SH3BP1Q9Y3L3 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SH3BP1Q9Y3L3 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SH3BP1Q9Y3L3 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SH3BP1Q9Y3L3 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SH3BP1Q9Y3L3 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SH3BP1Q9Y3L3 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SH3BP1Q9Y3L3 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SH3BP1Q9Y3L3 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SH3BP1Q9Y3L3 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SH3BP1Q9Y3L3 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SH3BP1Q9Y3L3 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SH3BP1Q9Y3L3 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SH3BP1Q9Y3L3 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
SH3BP1Q9Y3L3 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SH3BP1Q9Y3L3 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
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SH3BP1Q9Y3L3 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SH3BP1Q9Y3L3 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SH3BP1Q9Y3L3 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SH3BP1Q9Y3L3 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SH3BP1Q9Y3L3 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SH3BP1Q9Y3L3 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SH3BP1Q9Y3L3 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SH3BP1Q9Y3L3 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
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SH3BP1Q9Y3L3 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SH3BP1Q9Y3L3 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
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SH3BP1Q9Y3L3 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
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SH3BP1Q9Y3L3 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SH3BP1Q9Y3L3 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
SH3BP1Q9Y3L3 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SH3BP1Q9Y3L3 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SH3BP1Q9Y3L3 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
SH3BP1Q9Y3L3 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SH3BP1Q9Y3L3 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SH3BP1Q9Y3L3 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SH3BP1Q9Y3L3 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
SH3BP1Q9Y3L3 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SH3BP1Q9Y3L3 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SH3BP1Q9Y3L3 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SH3BP1Q9Y3L3 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SH3BP1Q9Y3L3 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SH3BP1Q9Y3L3 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SH3BP1Q9Y3L3 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SH3BP1Q9Y3L3 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SH3BP1Q9Y3L3 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SH3BP1Q9Y3L3 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SH3BP1Q9Y3L3 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SH3BP1Q9Y3L3 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SH3BP1Q9Y3L3 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SH3BP1Q9Y3L3 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SH3BP1Q9Y3L3 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
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