Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W7

KCNIP3, Calsenilin, humanhuman

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP3Q9Y2W7 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNIP3Q9Y2W7 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNIP3Q9Y2W7 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNIP3Q9Y2W7 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNIP3Q9Y2W7 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNIP3Q9Y2W7 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNIP3Q9Y2W7 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNIP3Q9Y2W7 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNIP3Q9Y2W7 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNIP3Q9Y2W7 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNIP3Q9Y2W7 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNIP3Q9Y2W7 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNIP3Q9Y2W7 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNIP3Q9Y2W7 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNIP3Q9Y2W7 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNIP3Q9Y2W7 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNIP3Q9Y2W7 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNIP3Q9Y2W7 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNIP3Q9Y2W7 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNIP3Q9Y2W7 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNIP3Q9Y2W7 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNIP3Q9Y2W7 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNIP3Q9Y2W7 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNIP3Q9Y2W7 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNIP3Q9Y2W7 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNIP3Q9Y2W7 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNIP3Q9Y2W7 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNIP3Q9Y2W7 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNIP3Q9Y2W7 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNIP3Q9Y2W7 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNIP3Q9Y2W7 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNIP3Q9Y2W7 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNIP3Q9Y2W7 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNIP3Q9Y2W7 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNIP3Q9Y2W7 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNIP3Q9Y2W7 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNIP3Q9Y2W7 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNIP3Q9Y2W7 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNIP3Q9Y2W7 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNIP3Q9Y2W7 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNIP3Q9Y2W7 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNIP3Q9Y2W7 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNIP3Q9Y2W7 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNIP3Q9Y2W7 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNIP3Q9Y2W7 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNIP3Q9Y2W7 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNIP3Q9Y2W7 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNIP3Q9Y2W7 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNIP3Q9Y2W7 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNIP3Q9Y2W7 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNIP3Q9Y2W7 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNIP3Q9Y2W7 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNIP3Q9Y2W7 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNIP3Q9Y2W7 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNIP3Q9Y2W7 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNIP3Q9Y2W7 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNIP3Q9Y2W7 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNIP3Q9Y2W7 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNIP3Q9Y2W7 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNIP3Q9Y2W7 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNIP3Q9Y2W7 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNIP3Q9Y2W7 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNIP3Q9Y2W7 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNIP3Q9Y2W7 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNIP3Q9Y2W7 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNIP3Q9Y2W7 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNIP3Q9Y2W7 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNIP3Q9Y2W7 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNIP3Q9Y2W7 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNIP3Q9Y2W7 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNIP3Q9Y2W7 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNIP3Q9Y2W7 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNIP3Q9Y2W7 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNIP3Q9Y2W7 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNIP3Q9Y2W7 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNIP3Q9Y2W7 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNIP3Q9Y2W7 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNIP3Q9Y2W7 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNIP3Q9Y2W7 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNIP3Q9Y2W7 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNIP3Q9Y2W7 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNIP3Q9Y2W7 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNIP3Q9Y2W7 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNIP3Q9Y2W7 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNIP3Q9Y2W7 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNIP3Q9Y2W7 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNIP3Q9Y2W7 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNIP3Q9Y2W7 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNIP3Q9Y2W7 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNIP3Q9Y2W7 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNIP3Q9Y2W7 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNIP3Q9Y2W7 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNIP3Q9Y2W7 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNIP3Q9Y2W7 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNIP3Q9Y2W7 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNIP3Q9Y2W7 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNIP3Q9Y2W7 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNIP3Q9Y2W7 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNIP3Q9Y2W7 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNIP3Q9Y2W7 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms