Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQF0

ERVW-1, Syncytin-1, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVW-1Q9UQF0 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVW-1Q9UQF0 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVW-1Q9UQF0 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVW-1Q9UQF0 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVW-1Q9UQF0 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVW-1Q9UQF0 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVW-1Q9UQF0 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVW-1Q9UQF0 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVW-1Q9UQF0 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVW-1Q9UQF0 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVW-1Q9UQF0 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVW-1Q9UQF0 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVW-1Q9UQF0 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVW-1Q9UQF0 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVW-1Q9UQF0 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVW-1Q9UQF0 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVW-1Q9UQF0 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVW-1Q9UQF0 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVW-1Q9UQF0 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVW-1Q9UQF0 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVW-1Q9UQF0 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVW-1Q9UQF0 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVW-1Q9UQF0 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVW-1Q9UQF0 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVW-1Q9UQF0 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVW-1Q9UQF0 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVW-1Q9UQF0 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVW-1Q9UQF0 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVW-1Q9UQF0 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVW-1Q9UQF0 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVW-1Q9UQF0 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVW-1Q9UQF0 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVW-1Q9UQF0 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVW-1Q9UQF0 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVW-1Q9UQF0 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVW-1Q9UQF0 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVW-1Q9UQF0 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVW-1Q9UQF0 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVW-1Q9UQF0 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVW-1Q9UQF0 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVW-1Q9UQF0 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVW-1Q9UQF0 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVW-1Q9UQF0 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVW-1Q9UQF0 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVW-1Q9UQF0 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVW-1Q9UQF0 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVW-1Q9UQF0 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVW-1Q9UQF0 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVW-1Q9UQF0 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVW-1Q9UQF0 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVW-1Q9UQF0 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVW-1Q9UQF0 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVW-1Q9UQF0 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVW-1Q9UQF0 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVW-1Q9UQF0 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ERVW-1Q9UQF0 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ERVW-1Q9UQF0 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ERVW-1Q9UQF0 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ERVW-1Q9UQF0 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ERVW-1Q9UQF0 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ERVW-1Q9UQF0 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ERVW-1Q9UQF0 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ERVW-1Q9UQF0 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ERVW-1Q9UQF0 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ERVW-1Q9UQF0 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ERVW-1Q9UQF0 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ERVW-1Q9UQF0 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ERVW-1Q9UQF0 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ERVW-1Q9UQF0 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ERVW-1Q9UQF0 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ERVW-1Q9UQF0 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
ERVW-1Q9UQF0 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ERVW-1Q9UQF0 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ERVW-1Q9UQF0 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ERVW-1Q9UQF0 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
ERVW-1Q9UQF0 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ERVW-1Q9UQF0 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ERVW-1Q9UQF0 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ERVW-1Q9UQF0 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ERVW-1Q9UQF0 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVW-1Q9UQF0 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVW-1Q9UQF0 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVW-1Q9UQF0 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVW-1Q9UQF0 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVW-1Q9UQF0 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVW-1Q9UQF0 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVW-1Q9UQF0 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVW-1Q9UQF0 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVW-1Q9UQF0 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVW-1Q9UQF0 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVW-1Q9UQF0 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVW-1Q9UQF0 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVW-1Q9UQF0 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVW-1Q9UQF0 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVW-1Q9UQF0 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVW-1Q9UQF0 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVW-1Q9UQF0 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVW-1Q9UQF0 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVW-1Q9UQF0 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVW-1Q9UQF0 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms