Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKX5

ITGA11, Integrin alpha-11, humanhuman

Predictions only

Length 1,188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA11Q9UKX5 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGA11Q9UKX5 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGA11Q9UKX5 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGA11Q9UKX5 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGA11Q9UKX5 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGA11Q9UKX5 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGA11Q9UKX5 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGA11Q9UKX5 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGA11Q9UKX5 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGA11Q9UKX5 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGA11Q9UKX5 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGA11Q9UKX5 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGA11Q9UKX5 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGA11Q9UKX5 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGA11Q9UKX5 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGA11Q9UKX5 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGA11Q9UKX5 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGA11Q9UKX5 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGA11Q9UKX5 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGA11Q9UKX5 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGA11Q9UKX5 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGA11Q9UKX5 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGA11Q9UKX5 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGA11Q9UKX5 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGA11Q9UKX5 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGA11Q9UKX5 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGA11Q9UKX5 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGA11Q9UKX5 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGA11Q9UKX5 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGA11Q9UKX5 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGA11Q9UKX5 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGA11Q9UKX5 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGA11Q9UKX5 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGA11Q9UKX5 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGA11Q9UKX5 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGA11Q9UKX5 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGA11Q9UKX5 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGA11Q9UKX5 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGA11Q9UKX5 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGA11Q9UKX5 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGA11Q9UKX5 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGA11Q9UKX5 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGA11Q9UKX5 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGA11Q9UKX5 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGA11Q9UKX5 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGA11Q9UKX5 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGA11Q9UKX5 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGA11Q9UKX5 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGA11Q9UKX5 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGA11Q9UKX5 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGA11Q9UKX5 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGA11Q9UKX5 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGA11Q9UKX5 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGA11Q9UKX5 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGA11Q9UKX5 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGA11Q9UKX5 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGA11Q9UKX5 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGA11Q9UKX5 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGA11Q9UKX5 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGA11Q9UKX5 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGA11Q9UKX5 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGA11Q9UKX5 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGA11Q9UKX5 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGA11Q9UKX5 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGA11Q9UKX5 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGA11Q9UKX5 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGA11Q9UKX5 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGA11Q9UKX5 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGA11Q9UKX5 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGA11Q9UKX5 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGA11Q9UKX5 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGA11Q9UKX5 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGA11Q9UKX5 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGA11Q9UKX5 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGA11Q9UKX5 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGA11Q9UKX5 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGA11Q9UKX5 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGA11Q9UKX5 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGA11Q9UKX5 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGA11Q9UKX5 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGA11Q9UKX5 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGA11Q9UKX5 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGA11Q9UKX5 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGA11Q9UKX5 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGA11Q9UKX5 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGA11Q9UKX5 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGA11Q9UKX5 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGA11Q9UKX5 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGA11Q9UKX5 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGA11Q9UKX5 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGA11Q9UKX5 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGA11Q9UKX5 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGA11Q9UKX5 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGA11Q9UKX5 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGA11Q9UKX5 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ITGA11Q9UKX5 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
ITGA11Q9UKX5 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ITGA11Q9UKX5 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGA11Q9UKX5 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGA11Q9UKX5 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms