Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKS6

PACSIN3, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3Q9UKS6 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PACSIN3Q9UKS6 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PACSIN3Q9UKS6 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PACSIN3Q9UKS6 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PACSIN3Q9UKS6 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PACSIN3Q9UKS6 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PACSIN3Q9UKS6 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PACSIN3Q9UKS6 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PACSIN3Q9UKS6 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PACSIN3Q9UKS6 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PACSIN3Q9UKS6 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PACSIN3Q9UKS6 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PACSIN3Q9UKS6 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PACSIN3Q9UKS6 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PACSIN3Q9UKS6 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PACSIN3Q9UKS6 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PACSIN3Q9UKS6 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PACSIN3Q9UKS6 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PACSIN3Q9UKS6 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PACSIN3Q9UKS6 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PACSIN3Q9UKS6 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PACSIN3Q9UKS6 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PACSIN3Q9UKS6 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PACSIN3Q9UKS6 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PACSIN3Q9UKS6 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PACSIN3Q9UKS6 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PACSIN3Q9UKS6 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PACSIN3Q9UKS6 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PACSIN3Q9UKS6 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PACSIN3Q9UKS6 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PACSIN3Q9UKS6 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PACSIN3Q9UKS6 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PACSIN3Q9UKS6 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PACSIN3Q9UKS6 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PACSIN3Q9UKS6 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PACSIN3Q9UKS6 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PACSIN3Q9UKS6 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PACSIN3Q9UKS6 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PACSIN3Q9UKS6 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PACSIN3Q9UKS6 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PACSIN3Q9UKS6 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PACSIN3Q9UKS6 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PACSIN3Q9UKS6 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PACSIN3Q9UKS6 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PACSIN3Q9UKS6 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PACSIN3Q9UKS6 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PACSIN3Q9UKS6 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PACSIN3Q9UKS6 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PACSIN3Q9UKS6 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PACSIN3Q9UKS6 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PACSIN3Q9UKS6 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PACSIN3Q9UKS6 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PACSIN3Q9UKS6 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PACSIN3Q9UKS6 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PACSIN3Q9UKS6 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PACSIN3Q9UKS6 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PACSIN3Q9UKS6 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PACSIN3Q9UKS6 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PACSIN3Q9UKS6 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PACSIN3Q9UKS6 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PACSIN3Q9UKS6 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PACSIN3Q9UKS6 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PACSIN3Q9UKS6 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PACSIN3Q9UKS6 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PACSIN3Q9UKS6 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PACSIN3Q9UKS6 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PACSIN3Q9UKS6 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PACSIN3Q9UKS6 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PACSIN3Q9UKS6 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PACSIN3Q9UKS6 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PACSIN3Q9UKS6 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PACSIN3Q9UKS6 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PACSIN3Q9UKS6 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PACSIN3Q9UKS6 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PACSIN3Q9UKS6 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PACSIN3Q9UKS6 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PACSIN3Q9UKS6 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PACSIN3Q9UKS6 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PACSIN3Q9UKS6 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PACSIN3Q9UKS6 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PACSIN3Q9UKS6 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PACSIN3Q9UKS6 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PACSIN3Q9UKS6 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PACSIN3Q9UKS6 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PACSIN3Q9UKS6 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PACSIN3Q9UKS6 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PACSIN3Q9UKS6 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PACSIN3Q9UKS6 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PACSIN3Q9UKS6 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PACSIN3Q9UKS6 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PACSIN3Q9UKS6 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PACSIN3Q9UKS6 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PACSIN3Q9UKS6 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PACSIN3Q9UKS6 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PACSIN3Q9UKS6 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PACSIN3Q9UKS6 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PACSIN3Q9UKS6 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PACSIN3Q9UKS6 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PACSIN3Q9UKS6 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PACSIN3Q9UKS6 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms