Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI42

CPA4, Carboxypeptidase A4, humanhuman

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPA4Q9UI42 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CPA4Q9UI42 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CPA4Q9UI42 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CPA4Q9UI42 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CPA4Q9UI42 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CPA4Q9UI42 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CPA4Q9UI42 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CPA4Q9UI42 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CPA4Q9UI42 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CPA4Q9UI42 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CPA4Q9UI42 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CPA4Q9UI42 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CPA4Q9UI42 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CPA4Q9UI42 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CPA4Q9UI42 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CPA4Q9UI42 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CPA4Q9UI42 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CPA4Q9UI42 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CPA4Q9UI42 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CPA4Q9UI42 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CPA4Q9UI42 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CPA4Q9UI42 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CPA4Q9UI42 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CPA4Q9UI42 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CPA4Q9UI42 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CPA4Q9UI42 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CPA4Q9UI42 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CPA4Q9UI42 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CPA4Q9UI42 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CPA4Q9UI42 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CPA4Q9UI42 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CPA4Q9UI42 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CPA4Q9UI42 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CPA4Q9UI42 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CPA4Q9UI42 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CPA4Q9UI42 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CPA4Q9UI42 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CPA4Q9UI42 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CPA4Q9UI42 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CPA4Q9UI42 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CPA4Q9UI42 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CPA4Q9UI42 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CPA4Q9UI42 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CPA4Q9UI42 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CPA4Q9UI42 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CPA4Q9UI42 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CPA4Q9UI42 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CPA4Q9UI42 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CPA4Q9UI42 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CPA4Q9UI42 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CPA4Q9UI42 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CPA4Q9UI42 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CPA4Q9UI42 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CPA4Q9UI42 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CPA4Q9UI42 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CPA4Q9UI42 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CPA4Q9UI42 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CPA4Q9UI42 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CPA4Q9UI42 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CPA4Q9UI42 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CPA4Q9UI42 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CPA4Q9UI42 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CPA4Q9UI42 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CPA4Q9UI42 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CPA4Q9UI42 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CPA4Q9UI42 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CPA4Q9UI42 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CPA4Q9UI42 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CPA4Q9UI42 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CPA4Q9UI42 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CPA4Q9UI42 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CPA4Q9UI42 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CPA4Q9UI42 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CPA4Q9UI42 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CPA4Q9UI42 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CPA4Q9UI42 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CPA4Q9UI42 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CPA4Q9UI42 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CPA4Q9UI42 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CPA4Q9UI42 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CPA4Q9UI42 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CPA4Q9UI42 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CPA4Q9UI42 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CPA4Q9UI42 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CPA4Q9UI42 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CPA4Q9UI42 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CPA4Q9UI42 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CPA4Q9UI42 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CPA4Q9UI42 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CPA4Q9UI42 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CPA4Q9UI42 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CPA4Q9UI42 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CPA4Q9UI42 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CPA4Q9UI42 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CPA4Q9UI42 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CPA4Q9UI42 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CPA4Q9UI42 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CPA4Q9UI42 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CPA4Q9UI42 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CPA4Q9UI42 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms