Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC9

NPC1L1, Niemann-Pick C1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPC1L1Q9UHC9 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NPC1L1Q9UHC9 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NPC1L1Q9UHC9 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NPC1L1Q9UHC9 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NPC1L1Q9UHC9 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NPC1L1Q9UHC9 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NPC1L1Q9UHC9 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NPC1L1Q9UHC9 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NPC1L1Q9UHC9 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NPC1L1Q9UHC9 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NPC1L1Q9UHC9 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
NPC1L1Q9UHC9 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NPC1L1Q9UHC9 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
NPC1L1Q9UHC9 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NPC1L1Q9UHC9 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NPC1L1Q9UHC9 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
NPC1L1Q9UHC9 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NPC1L1Q9UHC9 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NPC1L1Q9UHC9 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NPC1L1Q9UHC9 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NPC1L1Q9UHC9 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NPC1L1Q9UHC9 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NPC1L1Q9UHC9 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NPC1L1Q9UHC9 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
NPC1L1Q9UHC9 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NPC1L1Q9UHC9 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NPC1L1Q9UHC9 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
NPC1L1Q9UHC9 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NPC1L1Q9UHC9 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NPC1L1Q9UHC9 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NPC1L1Q9UHC9 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
NPC1L1Q9UHC9 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NPC1L1Q9UHC9 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NPC1L1Q9UHC9 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NPC1L1Q9UHC9 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NPC1L1Q9UHC9 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NPC1L1Q9UHC9 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NPC1L1Q9UHC9 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NPC1L1Q9UHC9 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NPC1L1Q9UHC9 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NPC1L1Q9UHC9 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NPC1L1Q9UHC9 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NPC1L1Q9UHC9 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NPC1L1Q9UHC9 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NPC1L1Q9UHC9 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NPC1L1Q9UHC9 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NPC1L1Q9UHC9 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NPC1L1Q9UHC9 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NPC1L1Q9UHC9 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NPC1L1Q9UHC9 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NPC1L1Q9UHC9 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NPC1L1Q9UHC9 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NPC1L1Q9UHC9 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NPC1L1Q9UHC9 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NPC1L1Q9UHC9 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NPC1L1Q9UHC9 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NPC1L1Q9UHC9 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NPC1L1Q9UHC9 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NPC1L1Q9UHC9 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NPC1L1Q9UHC9 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NPC1L1Q9UHC9 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
NPC1L1Q9UHC9 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NPC1L1Q9UHC9 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NPC1L1Q9UHC9 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NPC1L1Q9UHC9 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NPC1L1Q9UHC9 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
NPC1L1Q9UHC9 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NPC1L1Q9UHC9 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NPC1L1Q9UHC9 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NPC1L1Q9UHC9 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NPC1L1Q9UHC9 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NPC1L1Q9UHC9 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NPC1L1Q9UHC9 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NPC1L1Q9UHC9 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NPC1L1Q9UHC9 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
NPC1L1Q9UHC9 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NPC1L1Q9UHC9 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NPC1L1Q9UHC9 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
NPC1L1Q9UHC9 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NPC1L1Q9UHC9 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
NPC1L1Q9UHC9 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NPC1L1Q9UHC9 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NPC1L1Q9UHC9 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NPC1L1Q9UHC9 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NPC1L1Q9UHC9 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
NPC1L1Q9UHC9 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
NPC1L1Q9UHC9 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NPC1L1Q9UHC9 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NPC1L1Q9UHC9 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NPC1L1Q9UHC9 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NPC1L1Q9UHC9 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NPC1L1Q9UHC9 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NPC1L1Q9UHC9 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NPC1L1Q9UHC9 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NPC1L1Q9UHC9 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NPC1L1Q9UHC9 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NPC1L1Q9UHC9 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NPC1L1Q9UHC9 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NPC1L1Q9UHC9 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NPC1L1Q9UHC9 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms