Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH90

FBXO40, F-box only protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO40Q9UH90 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FBXO40Q9UH90 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FBXO40Q9UH90 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FBXO40Q9UH90 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FBXO40Q9UH90 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FBXO40Q9UH90 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FBXO40Q9UH90 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FBXO40Q9UH90 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FBXO40Q9UH90 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
FBXO40Q9UH90 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
FBXO40Q9UH90 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
FBXO40Q9UH90 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FBXO40Q9UH90 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FBXO40Q9UH90 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FBXO40Q9UH90 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FBXO40Q9UH90 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FBXO40Q9UH90 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FBXO40Q9UH90 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FBXO40Q9UH90 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FBXO40Q9UH90 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FBXO40Q9UH90 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FBXO40Q9UH90 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FBXO40Q9UH90 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FBXO40Q9UH90 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FBXO40Q9UH90 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FBXO40Q9UH90 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FBXO40Q9UH90 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FBXO40Q9UH90 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FBXO40Q9UH90 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
FBXO40Q9UH90 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
FBXO40Q9UH90 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FBXO40Q9UH90 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FBXO40Q9UH90 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FBXO40Q9UH90 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FBXO40Q9UH90 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FBXO40Q9UH90 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FBXO40Q9UH90 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
FBXO40Q9UH90 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FBXO40Q9UH90 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FBXO40Q9UH90 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FBXO40Q9UH90 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FBXO40Q9UH90 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FBXO40Q9UH90 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FBXO40Q9UH90 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FBXO40Q9UH90 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FBXO40Q9UH90 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FBXO40Q9UH90 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FBXO40Q9UH90 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FBXO40Q9UH90 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
FBXO40Q9UH90 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
FBXO40Q9UH90 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FBXO40Q9UH90 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FBXO40Q9UH90 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FBXO40Q9UH90 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FBXO40Q9UH90 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FBXO40Q9UH90 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
FBXO40Q9UH90 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
FBXO40Q9UH90 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FBXO40Q9UH90 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FBXO40Q9UH90 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FBXO40Q9UH90 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FBXO40Q9UH90 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FBXO40Q9UH90 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FBXO40Q9UH90 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FBXO40Q9UH90 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FBXO40Q9UH90 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FBXO40Q9UH90 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
FBXO40Q9UH90 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FBXO40Q9UH90 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FBXO40Q9UH90 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FBXO40Q9UH90 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FBXO40Q9UH90 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FBXO40Q9UH90 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FBXO40Q9UH90 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FBXO40Q9UH90 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FBXO40Q9UH90 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FBXO40Q9UH90 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FBXO40Q9UH90 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FBXO40Q9UH90 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FBXO40Q9UH90 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FBXO40Q9UH90 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FBXO40Q9UH90 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FBXO40Q9UH90 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FBXO40Q9UH90 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FBXO40Q9UH90 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FBXO40Q9UH90 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FBXO40Q9UH90 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FBXO40Q9UH90 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FBXO40Q9UH90 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FBXO40Q9UH90 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FBXO40Q9UH90 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FBXO40Q9UH90 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FBXO40Q9UH90 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FBXO40Q9UH90 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FBXO40Q9UH90 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FBXO40Q9UH90 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FBXO40Q9UH90 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FBXO40Q9UH90 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FBXO40Q9UH90 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FBXO40Q9UH90 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms