Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGM1

CHRNA9, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA9Q9UGM1 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHRNA9Q9UGM1 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHRNA9Q9UGM1 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHRNA9Q9UGM1 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHRNA9Q9UGM1 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CHRNA9Q9UGM1 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHRNA9Q9UGM1 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHRNA9Q9UGM1 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHRNA9Q9UGM1 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHRNA9Q9UGM1 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHRNA9Q9UGM1 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHRNA9Q9UGM1 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHRNA9Q9UGM1 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHRNA9Q9UGM1 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHRNA9Q9UGM1 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHRNA9Q9UGM1 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHRNA9Q9UGM1 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHRNA9Q9UGM1 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CHRNA9Q9UGM1 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHRNA9Q9UGM1 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHRNA9Q9UGM1 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHRNA9Q9UGM1 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHRNA9Q9UGM1 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHRNA9Q9UGM1 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHRNA9Q9UGM1 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHRNA9Q9UGM1 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHRNA9Q9UGM1 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CHRNA9Q9UGM1 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHRNA9Q9UGM1 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHRNA9Q9UGM1 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHRNA9Q9UGM1 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHRNA9Q9UGM1 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHRNA9Q9UGM1 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHRNA9Q9UGM1 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHRNA9Q9UGM1 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHRNA9Q9UGM1 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHRNA9Q9UGM1 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHRNA9Q9UGM1 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CHRNA9Q9UGM1 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHRNA9Q9UGM1 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CHRNA9Q9UGM1 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CHRNA9Q9UGM1 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CHRNA9Q9UGM1 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHRNA9Q9UGM1 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHRNA9Q9UGM1 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHRNA9Q9UGM1 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHRNA9Q9UGM1 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CHRNA9Q9UGM1 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHRNA9Q9UGM1 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHRNA9Q9UGM1 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHRNA9Q9UGM1 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHRNA9Q9UGM1 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHRNA9Q9UGM1 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHRNA9Q9UGM1 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHRNA9Q9UGM1 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHRNA9Q9UGM1 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHRNA9Q9UGM1 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHRNA9Q9UGM1 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHRNA9Q9UGM1 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHRNA9Q9UGM1 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CHRNA9Q9UGM1 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CHRNA9Q9UGM1 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHRNA9Q9UGM1 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHRNA9Q9UGM1 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHRNA9Q9UGM1 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHRNA9Q9UGM1 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHRNA9Q9UGM1 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHRNA9Q9UGM1 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHRNA9Q9UGM1 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHRNA9Q9UGM1 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHRNA9Q9UGM1 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHRNA9Q9UGM1 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHRNA9Q9UGM1 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHRNA9Q9UGM1 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHRNA9Q9UGM1 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHRNA9Q9UGM1 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHRNA9Q9UGM1 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHRNA9Q9UGM1 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHRNA9Q9UGM1 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHRNA9Q9UGM1 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CHRNA9Q9UGM1 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHRNA9Q9UGM1 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHRNA9Q9UGM1 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CHRNA9Q9UGM1 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHRNA9Q9UGM1 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHRNA9Q9UGM1 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHRNA9Q9UGM1 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHRNA9Q9UGM1 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHRNA9Q9UGM1 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHRNA9Q9UGM1 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHRNA9Q9UGM1 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHRNA9Q9UGM1 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHRNA9Q9UGM1 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHRNA9Q9UGM1 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHRNA9Q9UGM1 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHRNA9Q9UGM1 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHRNA9Q9UGM1 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHRNA9Q9UGM1 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHRNA9Q9UGM1 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHRNA9Q9UGM1 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms