Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
COPS7AQ9UBW8 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
COPS7AQ9UBW8 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
COPS7AQ9UBW8 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
COPS7AQ9UBW8 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
COPS7AQ9UBW8 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
COPS7AQ9UBW8 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
COPS7AQ9UBW8 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
COPS7AQ9UBW8 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
COPS7AQ9UBW8 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
COPS7AQ9UBW8 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
COPS7AQ9UBW8 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
COPS7AQ9UBW8 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
COPS7AQ9UBW8 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
COPS7AQ9UBW8 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
COPS7AQ9UBW8 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
COPS7AQ9UBW8 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
COPS7AQ9UBW8 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
COPS7AQ9UBW8 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
COPS7AQ9UBW8 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
COPS7AQ9UBW8 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
COPS7AQ9UBW8 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
COPS7AQ9UBW8 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
COPS7AQ9UBW8 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
COPS7AQ9UBW8 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
COPS7AQ9UBW8 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
COPS7AQ9UBW8 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
COPS7AQ9UBW8 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
COPS7AQ9UBW8 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
COPS7AQ9UBW8 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
COPS7AQ9UBW8 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
COPS7AQ9UBW8 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
COPS7AQ9UBW8 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
COPS7AQ9UBW8 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
COPS7AQ9UBW8 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
COPS7AQ9UBW8 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
COPS7AQ9UBW8 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
COPS7AQ9UBW8 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
COPS7AQ9UBW8 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
COPS7AQ9UBW8 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
COPS7AQ9UBW8 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
COPS7AQ9UBW8 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
COPS7AQ9UBW8 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
COPS7AQ9UBW8 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
COPS7AQ9UBW8 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
COPS7AQ9UBW8 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
COPS7AQ9UBW8 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
COPS7AQ9UBW8 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
COPS7AQ9UBW8 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
COPS7AQ9UBW8 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
COPS7AQ9UBW8 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
COPS7AQ9UBW8 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
COPS7AQ9UBW8 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
COPS7AQ9UBW8 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
COPS7AQ9UBW8 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
COPS7AQ9UBW8 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
COPS7AQ9UBW8 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
COPS7AQ9UBW8 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
COPS7AQ9UBW8 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
COPS7AQ9UBW8 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
COPS7AQ9UBW8 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
COPS7AQ9UBW8 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
COPS7AQ9UBW8 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
COPS7AQ9UBW8 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
COPS7AQ9UBW8 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
COPS7AQ9UBW8 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
COPS7AQ9UBW8 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
COPS7AQ9UBW8 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
COPS7AQ9UBW8 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
COPS7AQ9UBW8 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
COPS7AQ9UBW8 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
COPS7AQ9UBW8 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
COPS7AQ9UBW8 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
COPS7AQ9UBW8 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
COPS7AQ9UBW8 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
COPS7AQ9UBW8 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
COPS7AQ9UBW8 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
COPS7AQ9UBW8 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
COPS7AQ9UBW8 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
COPS7AQ9UBW8 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
COPS7AQ9UBW8 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
COPS7AQ9UBW8 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
COPS7AQ9UBW8 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
COPS7AQ9UBW8 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
COPS7AQ9UBW8 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
COPS7AQ9UBW8 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
COPS7AQ9UBW8 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
COPS7AQ9UBW8 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
COPS7AQ9UBW8 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
COPS7AQ9UBW8 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
COPS7AQ9UBW8 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
COPS7AQ9UBW8 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
COPS7AQ9UBW8 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
COPS7AQ9UBW8 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
COPS7AQ9UBW8 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
COPS7AQ9UBW8 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
COPS7AQ9UBW8 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
COPS7AQ9UBW8 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
COPS7AQ9UBW8 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
COPS7AQ9UBW8 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
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