Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC38.43■■■■□ 3.74
CCDC180Q9P1Z9 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
CCDC180Q9P1Z9 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC38.43■■■■□ 3.74
CCDC180Q9P1Z9 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC38.43■■■■□ 3.74
CCDC180Q9P1Z9 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC38.43■■■■□ 3.74
CCDC180Q9P1Z9 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC38.43■■■■□ 3.74
CCDC180Q9P1Z9 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC38.43■■■■□ 3.74
CCDC180Q9P1Z9 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC38.43■■■■□ 3.74
CCDC180Q9P1Z9 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
CCDC180Q9P1Z9 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
CCDC180Q9P1Z9 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
CCDC180Q9P1Z9 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC38.43■■■■□ 3.74
CCDC180Q9P1Z9 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
CCDC180Q9P1Z9 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
CCDC180Q9P1Z9 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC38.42■■■■□ 3.74
CCDC180Q9P1Z9 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
CCDC180Q9P1Z9 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC38.42■■■■□ 3.74
CCDC180Q9P1Z9 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
CCDC180Q9P1Z9 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.41■■■■□ 3.74
CCDC180Q9P1Z9 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC38.41■■■■□ 3.74
CCDC180Q9P1Z9 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.41■■■■□ 3.74
CCDC180Q9P1Z9 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC38.41■■■■□ 3.74
CCDC180Q9P1Z9 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC38.41■■■■□ 3.74
CCDC180Q9P1Z9 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC38.41■■■■□ 3.74
CCDC180Q9P1Z9 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
CCDC180Q9P1Z9 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
CCDC180Q9P1Z9 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC38.41■■■■□ 3.74
CCDC180Q9P1Z9 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
CCDC180Q9P1Z9 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC38.41■■■■□ 3.74
CCDC180Q9P1Z9 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC38.41■■■■□ 3.74
CCDC180Q9P1Z9 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC38.41■■■■□ 3.74
CCDC180Q9P1Z9 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC38.41■■■■□ 3.74
CCDC180Q9P1Z9 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC38.41■■■■□ 3.74
CCDC180Q9P1Z9 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.41■■■■□ 3.74
CCDC180Q9P1Z9 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC38.4■■■■□ 3.74
CCDC180Q9P1Z9 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
CCDC180Q9P1Z9 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.4■■■■□ 3.74
CCDC180Q9P1Z9 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
CCDC180Q9P1Z9 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
CCDC180Q9P1Z9 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
CCDC180Q9P1Z9 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC38.4■■■■□ 3.74
CCDC180Q9P1Z9 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
CCDC180Q9P1Z9 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
CCDC180Q9P1Z9 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC38.4■■■■□ 3.74
CCDC180Q9P1Z9 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC38.4■■■■□ 3.74
CCDC180Q9P1Z9 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC38.4■■■■□ 3.74
CCDC180Q9P1Z9 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.4■■■■□ 3.74
CCDC180Q9P1Z9 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
CCDC180Q9P1Z9 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
CCDC180Q9P1Z9 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
CCDC180Q9P1Z9 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
CCDC180Q9P1Z9 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
CCDC180Q9P1Z9 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
CCDC180Q9P1Z9 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
CCDC180Q9P1Z9 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC38.39■■■■□ 3.74
CCDC180Q9P1Z9 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC38.39■■■■□ 3.74
CCDC180Q9P1Z9 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.39■■■■□ 3.74
CCDC180Q9P1Z9 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC38.39■■■■□ 3.74
CCDC180Q9P1Z9 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC38.39■■■■□ 3.74
CCDC180Q9P1Z9 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC38.39■■■■□ 3.74
CCDC180Q9P1Z9 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
CCDC180Q9P1Z9 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
CCDC180Q9P1Z9 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC38.39■■■■□ 3.74
CCDC180Q9P1Z9 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC38.38■■■■□ 3.74
CCDC180Q9P1Z9 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.38■■■■□ 3.74
CCDC180Q9P1Z9 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC38.38■■■■□ 3.74
CCDC180Q9P1Z9 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC38.38■■■■□ 3.74
CCDC180Q9P1Z9 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC38.38■■■■□ 3.74
CCDC180Q9P1Z9 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC38.38■■■■□ 3.74
CCDC180Q9P1Z9 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC38.38■■■■□ 3.74
CCDC180Q9P1Z9 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC38.38■■■■□ 3.74
CCDC180Q9P1Z9 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
CCDC180Q9P1Z9 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC38.38■■■■□ 3.73
CCDC180Q9P1Z9 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC38.38■■■■□ 3.73
CCDC180Q9P1Z9 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC38.38■■■■□ 3.73
CCDC180Q9P1Z9 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC38.38■■■■□ 3.73
CCDC180Q9P1Z9 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
CCDC180Q9P1Z9 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC38.38■■■■□ 3.73
CCDC180Q9P1Z9 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.37■■■■□ 3.73
CCDC180Q9P1Z9 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
CCDC180Q9P1Z9 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
CCDC180Q9P1Z9 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
CCDC180Q9P1Z9 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC38.37■■■■□ 3.73
CCDC180Q9P1Z9 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC38.37■■■■□ 3.73
CCDC180Q9P1Z9 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.37■■■■□ 3.73
CCDC180Q9P1Z9 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC38.37■■■■□ 3.73
CCDC180Q9P1Z9 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC38.37■■■■□ 3.73
CCDC180Q9P1Z9 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
CCDC180Q9P1Z9 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
CCDC180Q9P1Z9 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
CCDC180Q9P1Z9 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
CCDC180Q9P1Z9 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
CCDC180Q9P1Z9 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC38.36■■■■□ 3.73
CCDC180Q9P1Z9 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
CCDC180Q9P1Z9 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC38.36■■■■□ 3.73
CCDC180Q9P1Z9 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC38.36■■■■□ 3.73
CCDC180Q9P1Z9 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.36■■■■□ 3.73
CCDC180Q9P1Z9 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
CCDC180Q9P1Z9 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC38.36■■■■□ 3.73
CCDC180Q9P1Z9 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC38.36■■■■□ 3.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms