Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SH3BP4Q9P0V3 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SH3BP4Q9P0V3 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SH3BP4Q9P0V3 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SH3BP4Q9P0V3 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SH3BP4Q9P0V3 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SH3BP4Q9P0V3 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SH3BP4Q9P0V3 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SH3BP4Q9P0V3 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SH3BP4Q9P0V3 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SH3BP4Q9P0V3 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SH3BP4Q9P0V3 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SH3BP4Q9P0V3 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SH3BP4Q9P0V3 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SH3BP4Q9P0V3 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SH3BP4Q9P0V3 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SH3BP4Q9P0V3 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SH3BP4Q9P0V3 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SH3BP4Q9P0V3 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SH3BP4Q9P0V3 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SH3BP4Q9P0V3 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SH3BP4Q9P0V3 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SH3BP4Q9P0V3 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SH3BP4Q9P0V3 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SH3BP4Q9P0V3 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SH3BP4Q9P0V3 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SH3BP4Q9P0V3 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SH3BP4Q9P0V3 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SH3BP4Q9P0V3 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SH3BP4Q9P0V3 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SH3BP4Q9P0V3 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SH3BP4Q9P0V3 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SH3BP4Q9P0V3 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SH3BP4Q9P0V3 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SH3BP4Q9P0V3 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SH3BP4Q9P0V3 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SH3BP4Q9P0V3 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SH3BP4Q9P0V3 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SH3BP4Q9P0V3 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SH3BP4Q9P0V3 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SH3BP4Q9P0V3 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SH3BP4Q9P0V3 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SH3BP4Q9P0V3 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SH3BP4Q9P0V3 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SH3BP4Q9P0V3 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SH3BP4Q9P0V3 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SH3BP4Q9P0V3 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SH3BP4Q9P0V3 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SH3BP4Q9P0V3 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SH3BP4Q9P0V3 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SH3BP4Q9P0V3 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SH3BP4Q9P0V3 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SH3BP4Q9P0V3 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SH3BP4Q9P0V3 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SH3BP4Q9P0V3 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SH3BP4Q9P0V3 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SH3BP4Q9P0V3 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SH3BP4Q9P0V3 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SH3BP4Q9P0V3 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SH3BP4Q9P0V3 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SH3BP4Q9P0V3 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SH3BP4Q9P0V3 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SH3BP4Q9P0V3 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SH3BP4Q9P0V3 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SH3BP4Q9P0V3 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SH3BP4Q9P0V3 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SH3BP4Q9P0V3 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SH3BP4Q9P0V3 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SH3BP4Q9P0V3 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SH3BP4Q9P0V3 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SH3BP4Q9P0V3 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SH3BP4Q9P0V3 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SH3BP4Q9P0V3 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SH3BP4Q9P0V3 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SH3BP4Q9P0V3 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SH3BP4Q9P0V3 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SH3BP4Q9P0V3 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SH3BP4Q9P0V3 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SH3BP4Q9P0V3 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SH3BP4Q9P0V3 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SH3BP4Q9P0V3 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SH3BP4Q9P0V3 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SH3BP4Q9P0V3 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SH3BP4Q9P0V3 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SH3BP4Q9P0V3 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SH3BP4Q9P0V3 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SH3BP4Q9P0V3 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SH3BP4Q9P0V3 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SH3BP4Q9P0V3 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SH3BP4Q9P0V3 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SH3BP4Q9P0V3 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SH3BP4Q9P0V3 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SH3BP4Q9P0V3 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SH3BP4Q9P0V3 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SH3BP4Q9P0V3 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SH3BP4Q9P0V3 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SH3BP4Q9P0V3 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SH3BP4Q9P0V3 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SH3BP4Q9P0V3 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SH3BP4Q9P0V3 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
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