Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
GDE1Q9NZC3 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GDE1Q9NZC3 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
GDE1Q9NZC3 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
GDE1Q9NZC3 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GDE1Q9NZC3 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GDE1Q9NZC3 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GDE1Q9NZC3 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GDE1Q9NZC3 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GDE1Q9NZC3 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GDE1Q9NZC3 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
GDE1Q9NZC3 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GDE1Q9NZC3 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GDE1Q9NZC3 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GDE1Q9NZC3 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GDE1Q9NZC3 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GDE1Q9NZC3 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GDE1Q9NZC3 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GDE1Q9NZC3 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GDE1Q9NZC3 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GDE1Q9NZC3 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GDE1Q9NZC3 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GDE1Q9NZC3 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GDE1Q9NZC3 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GDE1Q9NZC3 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GDE1Q9NZC3 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GDE1Q9NZC3 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GDE1Q9NZC3 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GDE1Q9NZC3 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GDE1Q9NZC3 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GDE1Q9NZC3 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GDE1Q9NZC3 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GDE1Q9NZC3 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GDE1Q9NZC3 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GDE1Q9NZC3 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GDE1Q9NZC3 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GDE1Q9NZC3 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GDE1Q9NZC3 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GDE1Q9NZC3 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
GDE1Q9NZC3 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GDE1Q9NZC3 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GDE1Q9NZC3 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GDE1Q9NZC3 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GDE1Q9NZC3 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GDE1Q9NZC3 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GDE1Q9NZC3 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GDE1Q9NZC3 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GDE1Q9NZC3 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GDE1Q9NZC3 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GDE1Q9NZC3 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
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GDE1Q9NZC3 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
GDE1Q9NZC3 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
GDE1Q9NZC3 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GDE1Q9NZC3 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GDE1Q9NZC3 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GDE1Q9NZC3 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GDE1Q9NZC3 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GDE1Q9NZC3 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
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GDE1Q9NZC3 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GDE1Q9NZC3 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GDE1Q9NZC3 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GDE1Q9NZC3 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GDE1Q9NZC3 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GDE1Q9NZC3 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
GDE1Q9NZC3 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
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GDE1Q9NZC3 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
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GDE1Q9NZC3 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GDE1Q9NZC3 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
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GDE1Q9NZC3 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
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GDE1Q9NZC3 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GDE1Q9NZC3 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GDE1Q9NZC3 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GDE1Q9NZC3 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GDE1Q9NZC3 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GDE1Q9NZC3 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GDE1Q9NZC3 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GDE1Q9NZC3 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GDE1Q9NZC3 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GDE1Q9NZC3 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GDE1Q9NZC3 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GDE1Q9NZC3 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GDE1Q9NZC3 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GDE1Q9NZC3 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
GDE1Q9NZC3 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GDE1Q9NZC3 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GDE1Q9NZC3 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GDE1Q9NZC3 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GDE1Q9NZC3 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GDE1Q9NZC3 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GDE1Q9NZC3 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GDE1Q9NZC3 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
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