Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYP9

MIS18A, Protein Mis18-alpha, humanhuman

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIS18AQ9NYP9 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MIS18AQ9NYP9 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
MIS18AQ9NYP9 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MIS18AQ9NYP9 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MIS18AQ9NYP9 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MIS18AQ9NYP9 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
MIS18AQ9NYP9 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
MIS18AQ9NYP9 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
MIS18AQ9NYP9 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MIS18AQ9NYP9 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MIS18AQ9NYP9 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MIS18AQ9NYP9 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MIS18AQ9NYP9 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MIS18AQ9NYP9 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MIS18AQ9NYP9 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MIS18AQ9NYP9 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MIS18AQ9NYP9 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MIS18AQ9NYP9 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MIS18AQ9NYP9 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MIS18AQ9NYP9 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MIS18AQ9NYP9 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MIS18AQ9NYP9 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MIS18AQ9NYP9 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MIS18AQ9NYP9 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MIS18AQ9NYP9 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MIS18AQ9NYP9 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MIS18AQ9NYP9 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MIS18AQ9NYP9 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MIS18AQ9NYP9 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MIS18AQ9NYP9 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MIS18AQ9NYP9 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MIS18AQ9NYP9 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MIS18AQ9NYP9 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MIS18AQ9NYP9 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MIS18AQ9NYP9 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MIS18AQ9NYP9 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MIS18AQ9NYP9 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MIS18AQ9NYP9 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
MIS18AQ9NYP9 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MIS18AQ9NYP9 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MIS18AQ9NYP9 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MIS18AQ9NYP9 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MIS18AQ9NYP9 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MIS18AQ9NYP9 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MIS18AQ9NYP9 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MIS18AQ9NYP9 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MIS18AQ9NYP9 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MIS18AQ9NYP9 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
MIS18AQ9NYP9 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MIS18AQ9NYP9 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MIS18AQ9NYP9 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MIS18AQ9NYP9 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MIS18AQ9NYP9 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MIS18AQ9NYP9 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MIS18AQ9NYP9 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MIS18AQ9NYP9 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MIS18AQ9NYP9 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MIS18AQ9NYP9 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MIS18AQ9NYP9 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MIS18AQ9NYP9 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
MIS18AQ9NYP9 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MIS18AQ9NYP9 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MIS18AQ9NYP9 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MIS18AQ9NYP9 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MIS18AQ9NYP9 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MIS18AQ9NYP9 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MIS18AQ9NYP9 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MIS18AQ9NYP9 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MIS18AQ9NYP9 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MIS18AQ9NYP9 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
MIS18AQ9NYP9 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
MIS18AQ9NYP9 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
MIS18AQ9NYP9 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MIS18AQ9NYP9 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MIS18AQ9NYP9 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MIS18AQ9NYP9 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MIS18AQ9NYP9 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MIS18AQ9NYP9 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MIS18AQ9NYP9 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MIS18AQ9NYP9 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MIS18AQ9NYP9 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MIS18AQ9NYP9 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MIS18AQ9NYP9 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MIS18AQ9NYP9 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MIS18AQ9NYP9 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MIS18AQ9NYP9 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MIS18AQ9NYP9 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MIS18AQ9NYP9 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MIS18AQ9NYP9 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MIS18AQ9NYP9 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MIS18AQ9NYP9 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MIS18AQ9NYP9 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MIS18AQ9NYP9 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MIS18AQ9NYP9 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MIS18AQ9NYP9 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MIS18AQ9NYP9 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
MIS18AQ9NYP9 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
MIS18AQ9NYP9 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MIS18AQ9NYP9 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MIS18AQ9NYP9 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
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