Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS15

LTBP3, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP3Q9NS15 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LTBP3Q9NS15 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LTBP3Q9NS15 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LTBP3Q9NS15 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LTBP3Q9NS15 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LTBP3Q9NS15 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LTBP3Q9NS15 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LTBP3Q9NS15 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LTBP3Q9NS15 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LTBP3Q9NS15 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
LTBP3Q9NS15 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LTBP3Q9NS15 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LTBP3Q9NS15 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LTBP3Q9NS15 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
LTBP3Q9NS15 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LTBP3Q9NS15 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LTBP3Q9NS15 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LTBP3Q9NS15 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
LTBP3Q9NS15 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LTBP3Q9NS15 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LTBP3Q9NS15 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LTBP3Q9NS15 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LTBP3Q9NS15 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LTBP3Q9NS15 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LTBP3Q9NS15 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LTBP3Q9NS15 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
LTBP3Q9NS15 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
LTBP3Q9NS15 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
LTBP3Q9NS15 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
LTBP3Q9NS15 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
LTBP3Q9NS15 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
LTBP3Q9NS15 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
LTBP3Q9NS15 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LTBP3Q9NS15 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LTBP3Q9NS15 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LTBP3Q9NS15 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LTBP3Q9NS15 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LTBP3Q9NS15 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LTBP3Q9NS15 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LTBP3Q9NS15 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LTBP3Q9NS15 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LTBP3Q9NS15 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
LTBP3Q9NS15 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LTBP3Q9NS15 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LTBP3Q9NS15 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LTBP3Q9NS15 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LTBP3Q9NS15 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LTBP3Q9NS15 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LTBP3Q9NS15 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LTBP3Q9NS15 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
LTBP3Q9NS15 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LTBP3Q9NS15 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LTBP3Q9NS15 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LTBP3Q9NS15 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LTBP3Q9NS15 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LTBP3Q9NS15 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LTBP3Q9NS15 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LTBP3Q9NS15 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LTBP3Q9NS15 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LTBP3Q9NS15 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LTBP3Q9NS15 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LTBP3Q9NS15 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LTBP3Q9NS15 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LTBP3Q9NS15 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LTBP3Q9NS15 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LTBP3Q9NS15 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LTBP3Q9NS15 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LTBP3Q9NS15 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LTBP3Q9NS15 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LTBP3Q9NS15 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
LTBP3Q9NS15 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
LTBP3Q9NS15 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
LTBP3Q9NS15 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LTBP3Q9NS15 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
LTBP3Q9NS15 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LTBP3Q9NS15 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LTBP3Q9NS15 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
LTBP3Q9NS15 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LTBP3Q9NS15 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LTBP3Q9NS15 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LTBP3Q9NS15 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LTBP3Q9NS15 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LTBP3Q9NS15 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LTBP3Q9NS15 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LTBP3Q9NS15 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LTBP3Q9NS15 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LTBP3Q9NS15 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LTBP3Q9NS15 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
LTBP3Q9NS15 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LTBP3Q9NS15 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LTBP3Q9NS15 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LTBP3Q9NS15 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LTBP3Q9NS15 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
LTBP3Q9NS15 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LTBP3Q9NS15 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
LTBP3Q9NS15 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LTBP3Q9NS15 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LTBP3Q9NS15 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LTBP3Q9NS15 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LTBP3Q9NS15 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms