Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ40

SLC52A3, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 3, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC52A3Q9NQ40 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC52A3Q9NQ40 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC52A3Q9NQ40 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC52A3Q9NQ40 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC52A3Q9NQ40 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC52A3Q9NQ40 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC52A3Q9NQ40 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC52A3Q9NQ40 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC52A3Q9NQ40 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SLC52A3Q9NQ40 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SLC52A3Q9NQ40 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SLC52A3Q9NQ40 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SLC52A3Q9NQ40 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SLC52A3Q9NQ40 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SLC52A3Q9NQ40 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SLC52A3Q9NQ40 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SLC52A3Q9NQ40 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SLC52A3Q9NQ40 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SLC52A3Q9NQ40 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SLC52A3Q9NQ40 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SLC52A3Q9NQ40 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC52A3Q9NQ40 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC52A3Q9NQ40 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC52A3Q9NQ40 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC52A3Q9NQ40 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC52A3Q9NQ40 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC52A3Q9NQ40 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC52A3Q9NQ40 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC52A3Q9NQ40 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC52A3Q9NQ40 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC52A3Q9NQ40 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC52A3Q9NQ40 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC52A3Q9NQ40 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC52A3Q9NQ40 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC52A3Q9NQ40 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC52A3Q9NQ40 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC52A3Q9NQ40 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC52A3Q9NQ40 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC52A3Q9NQ40 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC52A3Q9NQ40 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC52A3Q9NQ40 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC52A3Q9NQ40 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC52A3Q9NQ40 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC52A3Q9NQ40 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC52A3Q9NQ40 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC52A3Q9NQ40 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC52A3Q9NQ40 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC52A3Q9NQ40 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC52A3Q9NQ40 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC52A3Q9NQ40 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC52A3Q9NQ40 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC52A3Q9NQ40 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC52A3Q9NQ40 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC52A3Q9NQ40 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC52A3Q9NQ40 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC52A3Q9NQ40 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC52A3Q9NQ40 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC52A3Q9NQ40 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC52A3Q9NQ40 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC52A3Q9NQ40 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC52A3Q9NQ40 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC52A3Q9NQ40 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC52A3Q9NQ40 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC52A3Q9NQ40 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC52A3Q9NQ40 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC52A3Q9NQ40 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC52A3Q9NQ40 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC52A3Q9NQ40 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC52A3Q9NQ40 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC52A3Q9NQ40 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC52A3Q9NQ40 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC52A3Q9NQ40 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC52A3Q9NQ40 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC52A3Q9NQ40 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC52A3Q9NQ40 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC52A3Q9NQ40 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC52A3Q9NQ40 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC52A3Q9NQ40 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC52A3Q9NQ40 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC52A3Q9NQ40 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC52A3Q9NQ40 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC52A3Q9NQ40 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC52A3Q9NQ40 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC52A3Q9NQ40 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC52A3Q9NQ40 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC52A3Q9NQ40 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC52A3Q9NQ40 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC52A3Q9NQ40 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC52A3Q9NQ40 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC52A3Q9NQ40 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC52A3Q9NQ40 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC52A3Q9NQ40 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC52A3Q9NQ40 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC52A3Q9NQ40 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC52A3Q9NQ40 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC52A3Q9NQ40 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC52A3Q9NQ40 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC52A3Q9NQ40 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC52A3Q9NQ40 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC52A3Q9NQ40 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms