Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP64

ZCCHC17, Nucleolar protein of 40 kDa, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC17Q9NP64 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZCCHC17Q9NP64 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZCCHC17Q9NP64 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZCCHC17Q9NP64 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ZCCHC17Q9NP64 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZCCHC17Q9NP64 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ZCCHC17Q9NP64 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZCCHC17Q9NP64 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ZCCHC17Q9NP64 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ZCCHC17Q9NP64 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZCCHC17Q9NP64 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZCCHC17Q9NP64 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZCCHC17Q9NP64 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ZCCHC17Q9NP64 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZCCHC17Q9NP64 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZCCHC17Q9NP64 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZCCHC17Q9NP64 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZCCHC17Q9NP64 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZCCHC17Q9NP64 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZCCHC17Q9NP64 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZCCHC17Q9NP64 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZCCHC17Q9NP64 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZCCHC17Q9NP64 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZCCHC17Q9NP64 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZCCHC17Q9NP64 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZCCHC17Q9NP64 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZCCHC17Q9NP64 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZCCHC17Q9NP64 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZCCHC17Q9NP64 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZCCHC17Q9NP64 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZCCHC17Q9NP64 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZCCHC17Q9NP64 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZCCHC17Q9NP64 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZCCHC17Q9NP64 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZCCHC17Q9NP64 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZCCHC17Q9NP64 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZCCHC17Q9NP64 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ZCCHC17Q9NP64 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZCCHC17Q9NP64 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZCCHC17Q9NP64 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZCCHC17Q9NP64 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZCCHC17Q9NP64 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZCCHC17Q9NP64 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZCCHC17Q9NP64 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZCCHC17Q9NP64 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZCCHC17Q9NP64 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZCCHC17Q9NP64 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZCCHC17Q9NP64 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZCCHC17Q9NP64 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZCCHC17Q9NP64 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZCCHC17Q9NP64 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZCCHC17Q9NP64 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZCCHC17Q9NP64 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZCCHC17Q9NP64 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZCCHC17Q9NP64 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZCCHC17Q9NP64 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZCCHC17Q9NP64 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZCCHC17Q9NP64 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZCCHC17Q9NP64 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZCCHC17Q9NP64 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZCCHC17Q9NP64 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZCCHC17Q9NP64 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZCCHC17Q9NP64 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZCCHC17Q9NP64 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ZCCHC17Q9NP64 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZCCHC17Q9NP64 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZCCHC17Q9NP64 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZCCHC17Q9NP64 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZCCHC17Q9NP64 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZCCHC17Q9NP64 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZCCHC17Q9NP64 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZCCHC17Q9NP64 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZCCHC17Q9NP64 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZCCHC17Q9NP64 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZCCHC17Q9NP64 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZCCHC17Q9NP64 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZCCHC17Q9NP64 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZCCHC17Q9NP64 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ZCCHC17Q9NP64 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZCCHC17Q9NP64 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZCCHC17Q9NP64 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZCCHC17Q9NP64 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZCCHC17Q9NP64 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZCCHC17Q9NP64 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZCCHC17Q9NP64 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZCCHC17Q9NP64 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZCCHC17Q9NP64 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZCCHC17Q9NP64 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZCCHC17Q9NP64 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ZCCHC17Q9NP64 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZCCHC17Q9NP64 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ZCCHC17Q9NP64 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZCCHC17Q9NP64 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ZCCHC17Q9NP64 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZCCHC17Q9NP64 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ZCCHC17Q9NP64 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZCCHC17Q9NP64 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZCCHC17Q9NP64 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZCCHC17Q9NP64 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZCCHC17Q9NP64 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms