Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCF6

TRPM3, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPM3Q9HCF6 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRPM3Q9HCF6 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRPM3Q9HCF6 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRPM3Q9HCF6 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRPM3Q9HCF6 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
TRPM3Q9HCF6 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRPM3Q9HCF6 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRPM3Q9HCF6 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRPM3Q9HCF6 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRPM3Q9HCF6 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRPM3Q9HCF6 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
TRPM3Q9HCF6 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRPM3Q9HCF6 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRPM3Q9HCF6 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRPM3Q9HCF6 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRPM3Q9HCF6 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRPM3Q9HCF6 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRPM3Q9HCF6 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRPM3Q9HCF6 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRPM3Q9HCF6 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRPM3Q9HCF6 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRPM3Q9HCF6 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRPM3Q9HCF6 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRPM3Q9HCF6 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRPM3Q9HCF6 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRPM3Q9HCF6 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRPM3Q9HCF6 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRPM3Q9HCF6 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRPM3Q9HCF6 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRPM3Q9HCF6 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRPM3Q9HCF6 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRPM3Q9HCF6 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRPM3Q9HCF6 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
TRPM3Q9HCF6 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRPM3Q9HCF6 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRPM3Q9HCF6 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRPM3Q9HCF6 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRPM3Q9HCF6 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRPM3Q9HCF6 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRPM3Q9HCF6 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRPM3Q9HCF6 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRPM3Q9HCF6 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRPM3Q9HCF6 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRPM3Q9HCF6 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRPM3Q9HCF6 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRPM3Q9HCF6 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRPM3Q9HCF6 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRPM3Q9HCF6 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
TRPM3Q9HCF6 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRPM3Q9HCF6 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRPM3Q9HCF6 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRPM3Q9HCF6 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRPM3Q9HCF6 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRPM3Q9HCF6 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRPM3Q9HCF6 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRPM3Q9HCF6 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRPM3Q9HCF6 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
TRPM3Q9HCF6 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRPM3Q9HCF6 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRPM3Q9HCF6 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRPM3Q9HCF6 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRPM3Q9HCF6 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRPM3Q9HCF6 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRPM3Q9HCF6 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRPM3Q9HCF6 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRPM3Q9HCF6 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
TRPM3Q9HCF6 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRPM3Q9HCF6 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRPM3Q9HCF6 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRPM3Q9HCF6 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRPM3Q9HCF6 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRPM3Q9HCF6 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRPM3Q9HCF6 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRPM3Q9HCF6 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRPM3Q9HCF6 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRPM3Q9HCF6 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRPM3Q9HCF6 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRPM3Q9HCF6 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRPM3Q9HCF6 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRPM3Q9HCF6 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRPM3Q9HCF6 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRPM3Q9HCF6 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRPM3Q9HCF6 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRPM3Q9HCF6 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRPM3Q9HCF6 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRPM3Q9HCF6 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRPM3Q9HCF6 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRPM3Q9HCF6 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRPM3Q9HCF6 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRPM3Q9HCF6 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRPM3Q9HCF6 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRPM3Q9HCF6 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
TRPM3Q9HCF6 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRPM3Q9HCF6 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRPM3Q9HCF6 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRPM3Q9HCF6 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRPM3Q9HCF6 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRPM3Q9HCF6 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRPM3Q9HCF6 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRPM3Q9HCF6 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms