Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9D4

ZNF408, Zinc finger protein 408, humanhuman

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF408Q9H9D4 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF408Q9H9D4 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF408Q9H9D4 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF408Q9H9D4 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF408Q9H9D4 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF408Q9H9D4 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF408Q9H9D4 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF408Q9H9D4 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF408Q9H9D4 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF408Q9H9D4 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF408Q9H9D4 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF408Q9H9D4 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF408Q9H9D4 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF408Q9H9D4 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF408Q9H9D4 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF408Q9H9D4 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF408Q9H9D4 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF408Q9H9D4 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF408Q9H9D4 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF408Q9H9D4 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF408Q9H9D4 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF408Q9H9D4 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF408Q9H9D4 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF408Q9H9D4 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF408Q9H9D4 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZNF408Q9H9D4 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZNF408Q9H9D4 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
ZNF408Q9H9D4 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZNF408Q9H9D4 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZNF408Q9H9D4 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZNF408Q9H9D4 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZNF408Q9H9D4 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZNF408Q9H9D4 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZNF408Q9H9D4 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZNF408Q9H9D4 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
ZNF408Q9H9D4 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF408Q9H9D4 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF408Q9H9D4 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF408Q9H9D4 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF408Q9H9D4 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF408Q9H9D4 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF408Q9H9D4 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF408Q9H9D4 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF408Q9H9D4 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF408Q9H9D4 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF408Q9H9D4 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF408Q9H9D4 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF408Q9H9D4 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF408Q9H9D4 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF408Q9H9D4 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF408Q9H9D4 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF408Q9H9D4 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF408Q9H9D4 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF408Q9H9D4 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF408Q9H9D4 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF408Q9H9D4 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF408Q9H9D4 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF408Q9H9D4 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF408Q9H9D4 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF408Q9H9D4 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF408Q9H9D4 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF408Q9H9D4 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF408Q9H9D4 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF408Q9H9D4 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF408Q9H9D4 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF408Q9H9D4 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF408Q9H9D4 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF408Q9H9D4 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF408Q9H9D4 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF408Q9H9D4 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF408Q9H9D4 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF408Q9H9D4 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF408Q9H9D4 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF408Q9H9D4 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF408Q9H9D4 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF408Q9H9D4 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF408Q9H9D4 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF408Q9H9D4 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF408Q9H9D4 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF408Q9H9D4 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF408Q9H9D4 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF408Q9H9D4 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF408Q9H9D4 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF408Q9H9D4 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF408Q9H9D4 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF408Q9H9D4 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF408Q9H9D4 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF408Q9H9D4 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF408Q9H9D4 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF408Q9H9D4 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF408Q9H9D4 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF408Q9H9D4 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF408Q9H9D4 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF408Q9H9D4 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF408Q9H9D4 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF408Q9H9D4 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF408Q9H9D4 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF408Q9H9D4 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF408Q9H9D4 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF408Q9H9D4 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms