Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2J4

PDCL3, Phosducin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL3Q9H2J4 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDCL3Q9H2J4 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDCL3Q9H2J4 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDCL3Q9H2J4 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDCL3Q9H2J4 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDCL3Q9H2J4 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDCL3Q9H2J4 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDCL3Q9H2J4 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDCL3Q9H2J4 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDCL3Q9H2J4 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDCL3Q9H2J4 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDCL3Q9H2J4 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PDCL3Q9H2J4 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PDCL3Q9H2J4 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDCL3Q9H2J4 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDCL3Q9H2J4 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDCL3Q9H2J4 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDCL3Q9H2J4 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDCL3Q9H2J4 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDCL3Q9H2J4 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDCL3Q9H2J4 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDCL3Q9H2J4 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDCL3Q9H2J4 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDCL3Q9H2J4 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDCL3Q9H2J4 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDCL3Q9H2J4 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PDCL3Q9H2J4 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDCL3Q9H2J4 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDCL3Q9H2J4 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDCL3Q9H2J4 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDCL3Q9H2J4 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDCL3Q9H2J4 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDCL3Q9H2J4 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDCL3Q9H2J4 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDCL3Q9H2J4 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDCL3Q9H2J4 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDCL3Q9H2J4 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDCL3Q9H2J4 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDCL3Q9H2J4 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDCL3Q9H2J4 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDCL3Q9H2J4 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PDCL3Q9H2J4 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDCL3Q9H2J4 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDCL3Q9H2J4 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDCL3Q9H2J4 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDCL3Q9H2J4 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDCL3Q9H2J4 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDCL3Q9H2J4 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PDCL3Q9H2J4 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PDCL3Q9H2J4 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDCL3Q9H2J4 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDCL3Q9H2J4 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDCL3Q9H2J4 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDCL3Q9H2J4 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDCL3Q9H2J4 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDCL3Q9H2J4 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDCL3Q9H2J4 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDCL3Q9H2J4 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDCL3Q9H2J4 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDCL3Q9H2J4 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDCL3Q9H2J4 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDCL3Q9H2J4 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDCL3Q9H2J4 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDCL3Q9H2J4 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDCL3Q9H2J4 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDCL3Q9H2J4 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDCL3Q9H2J4 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PDCL3Q9H2J4 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PDCL3Q9H2J4 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDCL3Q9H2J4 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDCL3Q9H2J4 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDCL3Q9H2J4 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDCL3Q9H2J4 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDCL3Q9H2J4 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDCL3Q9H2J4 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDCL3Q9H2J4 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDCL3Q9H2J4 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PDCL3Q9H2J4 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PDCL3Q9H2J4 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PDCL3Q9H2J4 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PDCL3Q9H2J4 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PDCL3Q9H2J4 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PDCL3Q9H2J4 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PDCL3Q9H2J4 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PDCL3Q9H2J4 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PDCL3Q9H2J4 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PDCL3Q9H2J4 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
PDCL3Q9H2J4 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PDCL3Q9H2J4 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PDCL3Q9H2J4 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PDCL3Q9H2J4 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PDCL3Q9H2J4 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PDCL3Q9H2J4 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PDCL3Q9H2J4 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PDCL3Q9H2J4 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PDCL3Q9H2J4 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PDCL3Q9H2J4 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PDCL3Q9H2J4 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PDCL3Q9H2J4 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PDCL3Q9H2J4 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms