Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C4

SEMA4C, Semaphorin-4C, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4CQ9C0C4 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SEMA4CQ9C0C4 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SEMA4CQ9C0C4 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SEMA4CQ9C0C4 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SEMA4CQ9C0C4 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SEMA4CQ9C0C4 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SEMA4CQ9C0C4 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SEMA4CQ9C0C4 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SEMA4CQ9C0C4 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SEMA4CQ9C0C4 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SEMA4CQ9C0C4 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SEMA4CQ9C0C4 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SEMA4CQ9C0C4 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SEMA4CQ9C0C4 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SEMA4CQ9C0C4 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SEMA4CQ9C0C4 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SEMA4CQ9C0C4 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SEMA4CQ9C0C4 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SEMA4CQ9C0C4 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SEMA4CQ9C0C4 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SEMA4CQ9C0C4 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SEMA4CQ9C0C4 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SEMA4CQ9C0C4 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SEMA4CQ9C0C4 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SEMA4CQ9C0C4 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SEMA4CQ9C0C4 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SEMA4CQ9C0C4 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SEMA4CQ9C0C4 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SEMA4CQ9C0C4 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SEMA4CQ9C0C4 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SEMA4CQ9C0C4 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SEMA4CQ9C0C4 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SEMA4CQ9C0C4 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SEMA4CQ9C0C4 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SEMA4CQ9C0C4 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SEMA4CQ9C0C4 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SEMA4CQ9C0C4 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SEMA4CQ9C0C4 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SEMA4CQ9C0C4 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SEMA4CQ9C0C4 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SEMA4CQ9C0C4 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SEMA4CQ9C0C4 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SEMA4CQ9C0C4 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SEMA4CQ9C0C4 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SEMA4CQ9C0C4 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SEMA4CQ9C0C4 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SEMA4CQ9C0C4 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SEMA4CQ9C0C4 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SEMA4CQ9C0C4 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SEMA4CQ9C0C4 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SEMA4CQ9C0C4 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SEMA4CQ9C0C4 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SEMA4CQ9C0C4 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SEMA4CQ9C0C4 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SEMA4CQ9C0C4 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SEMA4CQ9C0C4 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SEMA4CQ9C0C4 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SEMA4CQ9C0C4 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SEMA4CQ9C0C4 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SEMA4CQ9C0C4 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SEMA4CQ9C0C4 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SEMA4CQ9C0C4 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SEMA4CQ9C0C4 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SEMA4CQ9C0C4 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SEMA4CQ9C0C4 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SEMA4CQ9C0C4 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SEMA4CQ9C0C4 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SEMA4CQ9C0C4 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SEMA4CQ9C0C4 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SEMA4CQ9C0C4 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SEMA4CQ9C0C4 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SEMA4CQ9C0C4 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SEMA4CQ9C0C4 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEMA4CQ9C0C4 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEMA4CQ9C0C4 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEMA4CQ9C0C4 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEMA4CQ9C0C4 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEMA4CQ9C0C4 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEMA4CQ9C0C4 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEMA4CQ9C0C4 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEMA4CQ9C0C4 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEMA4CQ9C0C4 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEMA4CQ9C0C4 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEMA4CQ9C0C4 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEMA4CQ9C0C4 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEMA4CQ9C0C4 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SEMA4CQ9C0C4 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEMA4CQ9C0C4 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEMA4CQ9C0C4 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEMA4CQ9C0C4 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SEMA4CQ9C0C4 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEMA4CQ9C0C4 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEMA4CQ9C0C4 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEMA4CQ9C0C4 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEMA4CQ9C0C4 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEMA4CQ9C0C4 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEMA4CQ9C0C4 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SEMA4CQ9C0C4 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEMA4CQ9C0C4 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEMA4CQ9C0C4 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms