Protein–RNA interactions for Protein: Q9C002

NMES1, Normal mucosa of esophagus-specific gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMES1Q9C002 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NMES1Q9C002 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NMES1Q9C002 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NMES1Q9C002 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NMES1Q9C002 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NMES1Q9C002 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NMES1Q9C002 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NMES1Q9C002 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NMES1Q9C002 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NMES1Q9C002 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NMES1Q9C002 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NMES1Q9C002 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NMES1Q9C002 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NMES1Q9C002 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NMES1Q9C002 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NMES1Q9C002 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NMES1Q9C002 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NMES1Q9C002 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NMES1Q9C002 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NMES1Q9C002 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NMES1Q9C002 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NMES1Q9C002 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NMES1Q9C002 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NMES1Q9C002 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NMES1Q9C002 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NMES1Q9C002 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NMES1Q9C002 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NMES1Q9C002 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NMES1Q9C002 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NMES1Q9C002 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NMES1Q9C002 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NMES1Q9C002 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NMES1Q9C002 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NMES1Q9C002 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NMES1Q9C002 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NMES1Q9C002 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NMES1Q9C002 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NMES1Q9C002 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NMES1Q9C002 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NMES1Q9C002 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NMES1Q9C002 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NMES1Q9C002 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NMES1Q9C002 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NMES1Q9C002 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NMES1Q9C002 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NMES1Q9C002 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NMES1Q9C002 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NMES1Q9C002 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NMES1Q9C002 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NMES1Q9C002 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NMES1Q9C002 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NMES1Q9C002 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NMES1Q9C002 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NMES1Q9C002 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NMES1Q9C002 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NMES1Q9C002 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NMES1Q9C002 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NMES1Q9C002 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NMES1Q9C002 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NMES1Q9C002 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NMES1Q9C002 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NMES1Q9C002 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NMES1Q9C002 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NMES1Q9C002 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NMES1Q9C002 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NMES1Q9C002 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NMES1Q9C002 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NMES1Q9C002 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NMES1Q9C002 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NMES1Q9C002 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NMES1Q9C002 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NMES1Q9C002 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NMES1Q9C002 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NMES1Q9C002 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NMES1Q9C002 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NMES1Q9C002 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NMES1Q9C002 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NMES1Q9C002 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NMES1Q9C002 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NMES1Q9C002 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NMES1Q9C002 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NMES1Q9C002 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NMES1Q9C002 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NMES1Q9C002 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NMES1Q9C002 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NMES1Q9C002 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NMES1Q9C002 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NMES1Q9C002 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NMES1Q9C002 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NMES1Q9C002 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NMES1Q9C002 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NMES1Q9C002 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NMES1Q9C002 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NMES1Q9C002 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NMES1Q9C002 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NMES1Q9C002 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NMES1Q9C002 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NMES1Q9C002 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NMES1Q9C002 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NMES1Q9C002 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms