Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZE3

BARHL1, BarH-like 1 homeobox protein, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BARHL1Q9BZE3 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BARHL1Q9BZE3 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BARHL1Q9BZE3 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BARHL1Q9BZE3 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BARHL1Q9BZE3 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BARHL1Q9BZE3 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BARHL1Q9BZE3 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BARHL1Q9BZE3 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
BARHL1Q9BZE3 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BARHL1Q9BZE3 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BARHL1Q9BZE3 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BARHL1Q9BZE3 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BARHL1Q9BZE3 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BARHL1Q9BZE3 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BARHL1Q9BZE3 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BARHL1Q9BZE3 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BARHL1Q9BZE3 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
BARHL1Q9BZE3 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BARHL1Q9BZE3 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BARHL1Q9BZE3 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BARHL1Q9BZE3 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BARHL1Q9BZE3 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BARHL1Q9BZE3 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BARHL1Q9BZE3 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
BARHL1Q9BZE3 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BARHL1Q9BZE3 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BARHL1Q9BZE3 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BARHL1Q9BZE3 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BARHL1Q9BZE3 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BARHL1Q9BZE3 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BARHL1Q9BZE3 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BARHL1Q9BZE3 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BARHL1Q9BZE3 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BARHL1Q9BZE3 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BARHL1Q9BZE3 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BARHL1Q9BZE3 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BARHL1Q9BZE3 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BARHL1Q9BZE3 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BARHL1Q9BZE3 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BARHL1Q9BZE3 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BARHL1Q9BZE3 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BARHL1Q9BZE3 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
BARHL1Q9BZE3 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BARHL1Q9BZE3 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BARHL1Q9BZE3 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
BARHL1Q9BZE3 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BARHL1Q9BZE3 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BARHL1Q9BZE3 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BARHL1Q9BZE3 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BARHL1Q9BZE3 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BARHL1Q9BZE3 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BARHL1Q9BZE3 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BARHL1Q9BZE3 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BARHL1Q9BZE3 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BARHL1Q9BZE3 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BARHL1Q9BZE3 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BARHL1Q9BZE3 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BARHL1Q9BZE3 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BARHL1Q9BZE3 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BARHL1Q9BZE3 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BARHL1Q9BZE3 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BARHL1Q9BZE3 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BARHL1Q9BZE3 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BARHL1Q9BZE3 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BARHL1Q9BZE3 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BARHL1Q9BZE3 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BARHL1Q9BZE3 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BARHL1Q9BZE3 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BARHL1Q9BZE3 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BARHL1Q9BZE3 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BARHL1Q9BZE3 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BARHL1Q9BZE3 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BARHL1Q9BZE3 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
BARHL1Q9BZE3 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BARHL1Q9BZE3 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BARHL1Q9BZE3 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BARHL1Q9BZE3 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BARHL1Q9BZE3 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BARHL1Q9BZE3 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BARHL1Q9BZE3 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
BARHL1Q9BZE3 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
BARHL1Q9BZE3 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BARHL1Q9BZE3 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BARHL1Q9BZE3 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BARHL1Q9BZE3 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BARHL1Q9BZE3 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
BARHL1Q9BZE3 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BARHL1Q9BZE3 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BARHL1Q9BZE3 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BARHL1Q9BZE3 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BARHL1Q9BZE3 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BARHL1Q9BZE3 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BARHL1Q9BZE3 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BARHL1Q9BZE3 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BARHL1Q9BZE3 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BARHL1Q9BZE3 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
BARHL1Q9BZE3 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BARHL1Q9BZE3 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BARHL1Q9BZE3 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BARHL1Q9BZE3 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms