Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV2

TRIM54, Tripartite motif-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM54Q9BYV2 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRIM54Q9BYV2 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRIM54Q9BYV2 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRIM54Q9BYV2 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRIM54Q9BYV2 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRIM54Q9BYV2 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRIM54Q9BYV2 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRIM54Q9BYV2 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRIM54Q9BYV2 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRIM54Q9BYV2 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRIM54Q9BYV2 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRIM54Q9BYV2 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM54Q9BYV2 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM54Q9BYV2 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM54Q9BYV2 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM54Q9BYV2 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM54Q9BYV2 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM54Q9BYV2 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM54Q9BYV2 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM54Q9BYV2 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM54Q9BYV2 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM54Q9BYV2 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM54Q9BYV2 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM54Q9BYV2 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM54Q9BYV2 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM54Q9BYV2 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM54Q9BYV2 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM54Q9BYV2 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM54Q9BYV2 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM54Q9BYV2 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM54Q9BYV2 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM54Q9BYV2 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM54Q9BYV2 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM54Q9BYV2 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM54Q9BYV2 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM54Q9BYV2 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM54Q9BYV2 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM54Q9BYV2 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM54Q9BYV2 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM54Q9BYV2 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM54Q9BYV2 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM54Q9BYV2 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM54Q9BYV2 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM54Q9BYV2 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM54Q9BYV2 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM54Q9BYV2 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TRIM54Q9BYV2 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TRIM54Q9BYV2 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TRIM54Q9BYV2 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TRIM54Q9BYV2 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TRIM54Q9BYV2 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TRIM54Q9BYV2 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TRIM54Q9BYV2 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TRIM54Q9BYV2 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TRIM54Q9BYV2 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TRIM54Q9BYV2 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRIM54Q9BYV2 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRIM54Q9BYV2 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRIM54Q9BYV2 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRIM54Q9BYV2 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRIM54Q9BYV2 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRIM54Q9BYV2 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRIM54Q9BYV2 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRIM54Q9BYV2 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
TRIM54Q9BYV2 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRIM54Q9BYV2 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRIM54Q9BYV2 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRIM54Q9BYV2 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRIM54Q9BYV2 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRIM54Q9BYV2 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRIM54Q9BYV2 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRIM54Q9BYV2 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRIM54Q9BYV2 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRIM54Q9BYV2 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRIM54Q9BYV2 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM54Q9BYV2 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM54Q9BYV2 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM54Q9BYV2 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM54Q9BYV2 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM54Q9BYV2 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM54Q9BYV2 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM54Q9BYV2 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM54Q9BYV2 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM54Q9BYV2 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM54Q9BYV2 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM54Q9BYV2 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM54Q9BYV2 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM54Q9BYV2 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM54Q9BYV2 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM54Q9BYV2 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM54Q9BYV2 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM54Q9BYV2 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM54Q9BYV2 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM54Q9BYV2 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM54Q9BYV2 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM54Q9BYV2 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM54Q9BYV2 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM54Q9BYV2 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM54Q9BYV2 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM54Q9BYV2 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms