Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms