Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NUP58Q9BVL2 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NUP58Q9BVL2 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NUP58Q9BVL2 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NUP58Q9BVL2 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NUP58Q9BVL2 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NUP58Q9BVL2 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NUP58Q9BVL2 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NUP58Q9BVL2 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NUP58Q9BVL2 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
NUP58Q9BVL2 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NUP58Q9BVL2 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NUP58Q9BVL2 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NUP58Q9BVL2 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NUP58Q9BVL2 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NUP58Q9BVL2 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NUP58Q9BVL2 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NUP58Q9BVL2 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NUP58Q9BVL2 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NUP58Q9BVL2 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NUP58Q9BVL2 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NUP58Q9BVL2 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NUP58Q9BVL2 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NUP58Q9BVL2 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NUP58Q9BVL2 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NUP58Q9BVL2 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NUP58Q9BVL2 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NUP58Q9BVL2 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NUP58Q9BVL2 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NUP58Q9BVL2 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NUP58Q9BVL2 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NUP58Q9BVL2 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NUP58Q9BVL2 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NUP58Q9BVL2 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
NUP58Q9BVL2 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NUP58Q9BVL2 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NUP58Q9BVL2 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NUP58Q9BVL2 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NUP58Q9BVL2 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NUP58Q9BVL2 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NUP58Q9BVL2 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NUP58Q9BVL2 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
NUP58Q9BVL2 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NUP58Q9BVL2 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NUP58Q9BVL2 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NUP58Q9BVL2 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NUP58Q9BVL2 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NUP58Q9BVL2 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NUP58Q9BVL2 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NUP58Q9BVL2 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NUP58Q9BVL2 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NUP58Q9BVL2 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NUP58Q9BVL2 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NUP58Q9BVL2 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NUP58Q9BVL2 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NUP58Q9BVL2 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NUP58Q9BVL2 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NUP58Q9BVL2 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
NUP58Q9BVL2 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NUP58Q9BVL2 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NUP58Q9BVL2 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NUP58Q9BVL2 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NUP58Q9BVL2 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NUP58Q9BVL2 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NUP58Q9BVL2 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NUP58Q9BVL2 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NUP58Q9BVL2 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
NUP58Q9BVL2 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NUP58Q9BVL2 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NUP58Q9BVL2 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NUP58Q9BVL2 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NUP58Q9BVL2 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NUP58Q9BVL2 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NUP58Q9BVL2 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NUP58Q9BVL2 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NUP58Q9BVL2 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NUP58Q9BVL2 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NUP58Q9BVL2 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NUP58Q9BVL2 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NUP58Q9BVL2 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NUP58Q9BVL2 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NUP58Q9BVL2 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
NUP58Q9BVL2 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NUP58Q9BVL2 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NUP58Q9BVL2 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NUP58Q9BVL2 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NUP58Q9BVL2 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NUP58Q9BVL2 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NUP58Q9BVL2 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NUP58Q9BVL2 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NUP58Q9BVL2 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NUP58Q9BVL2 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NUP58Q9BVL2 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NUP58Q9BVL2 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NUP58Q9BVL2 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
NUP58Q9BVL2 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NUP58Q9BVL2 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NUP58Q9BVL2 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NUP58Q9BVL2 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NUP58Q9BVL2 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms