Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTV4

TMEM43, Transmembrane protein 43, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM43Q9BTV4 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM43Q9BTV4 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM43Q9BTV4 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM43Q9BTV4 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM43Q9BTV4 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM43Q9BTV4 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM43Q9BTV4 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM43Q9BTV4 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM43Q9BTV4 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM43Q9BTV4 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM43Q9BTV4 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM43Q9BTV4 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM43Q9BTV4 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM43Q9BTV4 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM43Q9BTV4 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM43Q9BTV4 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM43Q9BTV4 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM43Q9BTV4 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM43Q9BTV4 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM43Q9BTV4 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM43Q9BTV4 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM43Q9BTV4 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM43Q9BTV4 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM43Q9BTV4 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM43Q9BTV4 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM43Q9BTV4 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM43Q9BTV4 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM43Q9BTV4 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM43Q9BTV4 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM43Q9BTV4 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM43Q9BTV4 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM43Q9BTV4 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM43Q9BTV4 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM43Q9BTV4 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM43Q9BTV4 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM43Q9BTV4 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM43Q9BTV4 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM43Q9BTV4 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM43Q9BTV4 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM43Q9BTV4 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM43Q9BTV4 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM43Q9BTV4 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM43Q9BTV4 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM43Q9BTV4 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM43Q9BTV4 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM43Q9BTV4 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM43Q9BTV4 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM43Q9BTV4 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM43Q9BTV4 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM43Q9BTV4 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM43Q9BTV4 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM43Q9BTV4 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM43Q9BTV4 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM43Q9BTV4 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM43Q9BTV4 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM43Q9BTV4 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM43Q9BTV4 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM43Q9BTV4 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM43Q9BTV4 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM43Q9BTV4 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM43Q9BTV4 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM43Q9BTV4 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM43Q9BTV4 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM43Q9BTV4 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM43Q9BTV4 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM43Q9BTV4 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM43Q9BTV4 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM43Q9BTV4 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM43Q9BTV4 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM43Q9BTV4 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM43Q9BTV4 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM43Q9BTV4 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM43Q9BTV4 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM43Q9BTV4 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM43Q9BTV4 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM43Q9BTV4 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM43Q9BTV4 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM43Q9BTV4 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM43Q9BTV4 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM43Q9BTV4 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM43Q9BTV4 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM43Q9BTV4 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM43Q9BTV4 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM43Q9BTV4 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM43Q9BTV4 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM43Q9BTV4 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM43Q9BTV4 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM43Q9BTV4 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM43Q9BTV4 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM43Q9BTV4 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM43Q9BTV4 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM43Q9BTV4 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM43Q9BTV4 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM43Q9BTV4 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM43Q9BTV4 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM43Q9BTV4 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM43Q9BTV4 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM43Q9BTV4 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM43Q9BTV4 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM43Q9BTV4 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms