Protein–RNA interactions for Protein: Q99697

PITX2, Pituitary homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX2Q99697 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PITX2Q99697 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PITX2Q99697 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PITX2Q99697 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PITX2Q99697 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PITX2Q99697 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PITX2Q99697 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PITX2Q99697 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PITX2Q99697 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PITX2Q99697 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PITX2Q99697 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PITX2Q99697 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PITX2Q99697 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PITX2Q99697 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PITX2Q99697 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PITX2Q99697 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PITX2Q99697 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PITX2Q99697 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PITX2Q99697 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PITX2Q99697 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PITX2Q99697 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PITX2Q99697 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PITX2Q99697 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PITX2Q99697 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PITX2Q99697 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PITX2Q99697 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PITX2Q99697 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PITX2Q99697 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PITX2Q99697 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PITX2Q99697 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PITX2Q99697 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PITX2Q99697 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PITX2Q99697 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PITX2Q99697 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PITX2Q99697 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PITX2Q99697 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PITX2Q99697 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PITX2Q99697 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PITX2Q99697 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PITX2Q99697 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PITX2Q99697 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PITX2Q99697 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PITX2Q99697 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PITX2Q99697 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PITX2Q99697 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PITX2Q99697 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PITX2Q99697 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PITX2Q99697 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PITX2Q99697 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PITX2Q99697 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PITX2Q99697 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PITX2Q99697 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PITX2Q99697 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PITX2Q99697 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PITX2Q99697 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PITX2Q99697 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PITX2Q99697 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PITX2Q99697 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PITX2Q99697 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PITX2Q99697 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PITX2Q99697 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PITX2Q99697 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PITX2Q99697 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PITX2Q99697 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PITX2Q99697 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PITX2Q99697 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PITX2Q99697 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PITX2Q99697 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PITX2Q99697 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PITX2Q99697 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PITX2Q99697 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PITX2Q99697 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PITX2Q99697 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PITX2Q99697 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PITX2Q99697 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PITX2Q99697 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PITX2Q99697 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PITX2Q99697 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PITX2Q99697 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PITX2Q99697 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PITX2Q99697 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PITX2Q99697 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PITX2Q99697 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PITX2Q99697 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PITX2Q99697 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PITX2Q99697 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PITX2Q99697 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PITX2Q99697 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PITX2Q99697 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PITX2Q99697 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PITX2Q99697 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PITX2Q99697 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PITX2Q99697 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PITX2Q99697 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PITX2Q99697 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PITX2Q99697 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PITX2Q99697 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PITX2Q99697 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PITX2Q99697 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PITX2Q99697 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms