Protein–RNA interactions for Protein: Q99567

NUP88, Nuclear pore complex protein Nup88, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP88Q99567 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NUP88Q99567 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NUP88Q99567 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NUP88Q99567 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NUP88Q99567 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NUP88Q99567 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NUP88Q99567 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NUP88Q99567 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NUP88Q99567 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NUP88Q99567 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NUP88Q99567 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NUP88Q99567 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NUP88Q99567 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NUP88Q99567 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NUP88Q99567 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NUP88Q99567 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NUP88Q99567 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NUP88Q99567 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NUP88Q99567 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUP88Q99567 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUP88Q99567 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUP88Q99567 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUP88Q99567 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUP88Q99567 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUP88Q99567 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUP88Q99567 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUP88Q99567 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUP88Q99567 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUP88Q99567 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUP88Q99567 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUP88Q99567 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUP88Q99567 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUP88Q99567 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUP88Q99567 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUP88Q99567 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUP88Q99567 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUP88Q99567 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUP88Q99567 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
NUP88Q99567 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUP88Q99567 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
NUP88Q99567 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUP88Q99567 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUP88Q99567 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUP88Q99567 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUP88Q99567 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUP88Q99567 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NUP88Q99567 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NUP88Q99567 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NUP88Q99567 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NUP88Q99567 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NUP88Q99567 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
NUP88Q99567 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
NUP88Q99567 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NUP88Q99567 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NUP88Q99567 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NUP88Q99567 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NUP88Q99567 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NUP88Q99567 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
NUP88Q99567 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NUP88Q99567 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NUP88Q99567 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NUP88Q99567 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NUP88Q99567 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NUP88Q99567 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NUP88Q99567 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NUP88Q99567 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NUP88Q99567 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NUP88Q99567 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NUP88Q99567 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NUP88Q99567 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NUP88Q99567 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NUP88Q99567 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NUP88Q99567 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NUP88Q99567 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NUP88Q99567 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NUP88Q99567 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NUP88Q99567 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NUP88Q99567 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NUP88Q99567 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NUP88Q99567 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NUP88Q99567 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NUP88Q99567 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NUP88Q99567 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NUP88Q99567 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NUP88Q99567 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NUP88Q99567 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NUP88Q99567 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NUP88Q99567 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NUP88Q99567 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NUP88Q99567 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NUP88Q99567 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NUP88Q99567 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NUP88Q99567 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NUP88Q99567 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NUP88Q99567 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NUP88Q99567 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NUP88Q99567 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NUP88Q99567 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
NUP88Q99567 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NUP88Q99567 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.2 ms