Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q04

LMTK3, Serine/threonine-protein kinase LMTK3, humanhuman

Predictions only

Length 1,460 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMTK3Q96Q04 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
LMTK3Q96Q04 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
LMTK3Q96Q04 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
LMTK3Q96Q04 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
LMTK3Q96Q04 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC26.98■■□□□ 1.91
LMTK3Q96Q04 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC26.98■■□□□ 1.91
LMTK3Q96Q04 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
LMTK3Q96Q04 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
LMTK3Q96Q04 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
LMTK3Q96Q04 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
LMTK3Q96Q04 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
LMTK3Q96Q04 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
LMTK3Q96Q04 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
LMTK3Q96Q04 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
LMTK3Q96Q04 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
LMTK3Q96Q04 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
LMTK3Q96Q04 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
LMTK3Q96Q04 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
LMTK3Q96Q04 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
LMTK3Q96Q04 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
LMTK3Q96Q04 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
LMTK3Q96Q04 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
LMTK3Q96Q04 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
LMTK3Q96Q04 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
LMTK3Q96Q04 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
LMTK3Q96Q04 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
LMTK3Q96Q04 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
LMTK3Q96Q04 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
LMTK3Q96Q04 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
LMTK3Q96Q04 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
LMTK3Q96Q04 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
LMTK3Q96Q04 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
LMTK3Q96Q04 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
LMTK3Q96Q04 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
LMTK3Q96Q04 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
LMTK3Q96Q04 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
LMTK3Q96Q04 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC26.96■■□□□ 1.91
LMTK3Q96Q04 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
LMTK3Q96Q04 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
LMTK3Q96Q04 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
LMTK3Q96Q04 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
LMTK3Q96Q04 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
LMTK3Q96Q04 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
LMTK3Q96Q04 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
LMTK3Q96Q04 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
LMTK3Q96Q04 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
LMTK3Q96Q04 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
LMTK3Q96Q04 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
LMTK3Q96Q04 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
LMTK3Q96Q04 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
LMTK3Q96Q04 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
LMTK3Q96Q04 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
LMTK3Q96Q04 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
LMTK3Q96Q04 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
LMTK3Q96Q04 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
LMTK3Q96Q04 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
LMTK3Q96Q04 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
LMTK3Q96Q04 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
LMTK3Q96Q04 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
LMTK3Q96Q04 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
LMTK3Q96Q04 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
LMTK3Q96Q04 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
LMTK3Q96Q04 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
LMTK3Q96Q04 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
LMTK3Q96Q04 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
LMTK3Q96Q04 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
LMTK3Q96Q04 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
LMTK3Q96Q04 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
LMTK3Q96Q04 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
LMTK3Q96Q04 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
LMTK3Q96Q04 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
LMTK3Q96Q04 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
LMTK3Q96Q04 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
LMTK3Q96Q04 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
LMTK3Q96Q04 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
LMTK3Q96Q04 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
LMTK3Q96Q04 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
LMTK3Q96Q04 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
LMTK3Q96Q04 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
LMTK3Q96Q04 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
LMTK3Q96Q04 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
LMTK3Q96Q04 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
LMTK3Q96Q04 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
LMTK3Q96Q04 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
LMTK3Q96Q04 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
LMTK3Q96Q04 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
LMTK3Q96Q04 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
LMTK3Q96Q04 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
LMTK3Q96Q04 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
LMTK3Q96Q04 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LMTK3Q96Q04 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
LMTK3Q96Q04 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
LMTK3Q96Q04 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
LMTK3Q96Q04 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
LMTK3Q96Q04 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
LMTK3Q96Q04 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
LMTK3Q96Q04 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
LMTK3Q96Q04 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
LMTK3Q96Q04 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
LMTK3Q96Q04 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms