Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT7

C9orf72, Guanine nucleotide exchange C9orf72, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf72Q96LT7 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
C9orf72Q96LT7 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
C9orf72Q96LT7 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
C9orf72Q96LT7 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
C9orf72Q96LT7 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
C9orf72Q96LT7 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
C9orf72Q96LT7 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
C9orf72Q96LT7 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
C9orf72Q96LT7 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
C9orf72Q96LT7 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
C9orf72Q96LT7 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
C9orf72Q96LT7 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
C9orf72Q96LT7 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
C9orf72Q96LT7 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
C9orf72Q96LT7 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
C9orf72Q96LT7 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
C9orf72Q96LT7 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
C9orf72Q96LT7 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
C9orf72Q96LT7 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
C9orf72Q96LT7 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
C9orf72Q96LT7 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
C9orf72Q96LT7 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
C9orf72Q96LT7 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
C9orf72Q96LT7 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
C9orf72Q96LT7 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
C9orf72Q96LT7 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
C9orf72Q96LT7 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
C9orf72Q96LT7 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
C9orf72Q96LT7 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
C9orf72Q96LT7 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
C9orf72Q96LT7 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
C9orf72Q96LT7 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
C9orf72Q96LT7 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
C9orf72Q96LT7 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
C9orf72Q96LT7 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
C9orf72Q96LT7 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
C9orf72Q96LT7 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
C9orf72Q96LT7 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
C9orf72Q96LT7 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
C9orf72Q96LT7 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
C9orf72Q96LT7 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
C9orf72Q96LT7 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
C9orf72Q96LT7 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
C9orf72Q96LT7 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
C9orf72Q96LT7 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
C9orf72Q96LT7 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
C9orf72Q96LT7 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
C9orf72Q96LT7 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
C9orf72Q96LT7 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
C9orf72Q96LT7 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
C9orf72Q96LT7 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
C9orf72Q96LT7 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
C9orf72Q96LT7 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
C9orf72Q96LT7 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
C9orf72Q96LT7 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
C9orf72Q96LT7 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
C9orf72Q96LT7 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
C9orf72Q96LT7 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
C9orf72Q96LT7 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
C9orf72Q96LT7 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
C9orf72Q96LT7 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
C9orf72Q96LT7 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
C9orf72Q96LT7 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
C9orf72Q96LT7 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
C9orf72Q96LT7 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
C9orf72Q96LT7 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
C9orf72Q96LT7 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
C9orf72Q96LT7 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
C9orf72Q96LT7 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
C9orf72Q96LT7 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
C9orf72Q96LT7 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
C9orf72Q96LT7 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
C9orf72Q96LT7 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
C9orf72Q96LT7 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
C9orf72Q96LT7 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
C9orf72Q96LT7 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
C9orf72Q96LT7 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
C9orf72Q96LT7 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
C9orf72Q96LT7 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
C9orf72Q96LT7 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
C9orf72Q96LT7 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
C9orf72Q96LT7 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
C9orf72Q96LT7 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
C9orf72Q96LT7 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
C9orf72Q96LT7 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
C9orf72Q96LT7 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
C9orf72Q96LT7 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
C9orf72Q96LT7 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
C9orf72Q96LT7 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
C9orf72Q96LT7 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
C9orf72Q96LT7 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
C9orf72Q96LT7 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
C9orf72Q96LT7 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
C9orf72Q96LT7 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
C9orf72Q96LT7 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
C9orf72Q96LT7 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
C9orf72Q96LT7 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
C9orf72Q96LT7 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
C9orf72Q96LT7 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
C9orf72Q96LT7 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms