Protein–RNA interactions for Protein: Q96LR5

UBE2E2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E2Q96LR5 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBE2E2Q96LR5 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBE2E2Q96LR5 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBE2E2Q96LR5 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBE2E2Q96LR5 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBE2E2Q96LR5 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBE2E2Q96LR5 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBE2E2Q96LR5 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
UBE2E2Q96LR5 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.07
UBE2E2Q96LR5 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
UBE2E2Q96LR5 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
UBE2E2Q96LR5 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
UBE2E2Q96LR5 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
UBE2E2Q96LR5 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
UBE2E2Q96LR5 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
UBE2E2Q96LR5 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
UBE2E2Q96LR5 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
UBE2E2Q96LR5 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
UBE2E2Q96LR5 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
UBE2E2Q96LR5 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
UBE2E2Q96LR5 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
UBE2E2Q96LR5 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
UBE2E2Q96LR5 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
UBE2E2Q96LR5 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
UBE2E2Q96LR5 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
UBE2E2Q96LR5 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
UBE2E2Q96LR5 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
UBE2E2Q96LR5 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
UBE2E2Q96LR5 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
UBE2E2Q96LR5 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
UBE2E2Q96LR5 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
UBE2E2Q96LR5 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
UBE2E2Q96LR5 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
UBE2E2Q96LR5 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
UBE2E2Q96LR5 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
UBE2E2Q96LR5 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
UBE2E2Q96LR5 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
UBE2E2Q96LR5 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
UBE2E2Q96LR5 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
UBE2E2Q96LR5 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
UBE2E2Q96LR5 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
UBE2E2Q96LR5 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
UBE2E2Q96LR5 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
UBE2E2Q96LR5 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
UBE2E2Q96LR5 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
UBE2E2Q96LR5 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
UBE2E2Q96LR5 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
UBE2E2Q96LR5 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
UBE2E2Q96LR5 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
UBE2E2Q96LR5 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
UBE2E2Q96LR5 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
UBE2E2Q96LR5 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
UBE2E2Q96LR5 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
UBE2E2Q96LR5 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
UBE2E2Q96LR5 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
UBE2E2Q96LR5 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
UBE2E2Q96LR5 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
UBE2E2Q96LR5 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
UBE2E2Q96LR5 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
UBE2E2Q96LR5 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
UBE2E2Q96LR5 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
UBE2E2Q96LR5 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
UBE2E2Q96LR5 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
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UBE2E2Q96LR5 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
UBE2E2Q96LR5 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
UBE2E2Q96LR5 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
UBE2E2Q96LR5 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
UBE2E2Q96LR5 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
UBE2E2Q96LR5 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
UBE2E2Q96LR5 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
UBE2E2Q96LR5 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
UBE2E2Q96LR5 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
UBE2E2Q96LR5 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
UBE2E2Q96LR5 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
UBE2E2Q96LR5 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
UBE2E2Q96LR5 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
UBE2E2Q96LR5 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
UBE2E2Q96LR5 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
UBE2E2Q96LR5 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
UBE2E2Q96LR5 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
UBE2E2Q96LR5 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
UBE2E2Q96LR5 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
UBE2E2Q96LR5 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
UBE2E2Q96LR5 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
UBE2E2Q96LR5 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
UBE2E2Q96LR5 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
UBE2E2Q96LR5 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
UBE2E2Q96LR5 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
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