Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD4

TRIM47, Tripartite motif-containing protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM47Q96LD4 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM47Q96LD4 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM47Q96LD4 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM47Q96LD4 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM47Q96LD4 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM47Q96LD4 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM47Q96LD4 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM47Q96LD4 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM47Q96LD4 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM47Q96LD4 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM47Q96LD4 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM47Q96LD4 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM47Q96LD4 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM47Q96LD4 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM47Q96LD4 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM47Q96LD4 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM47Q96LD4 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM47Q96LD4 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM47Q96LD4 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM47Q96LD4 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM47Q96LD4 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM47Q96LD4 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM47Q96LD4 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM47Q96LD4 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM47Q96LD4 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM47Q96LD4 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM47Q96LD4 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM47Q96LD4 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM47Q96LD4 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM47Q96LD4 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM47Q96LD4 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM47Q96LD4 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM47Q96LD4 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM47Q96LD4 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM47Q96LD4 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM47Q96LD4 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM47Q96LD4 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM47Q96LD4 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM47Q96LD4 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM47Q96LD4 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM47Q96LD4 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM47Q96LD4 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM47Q96LD4 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM47Q96LD4 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM47Q96LD4 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM47Q96LD4 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM47Q96LD4 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM47Q96LD4 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM47Q96LD4 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM47Q96LD4 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM47Q96LD4 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM47Q96LD4 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM47Q96LD4 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM47Q96LD4 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM47Q96LD4 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM47Q96LD4 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM47Q96LD4 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM47Q96LD4 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM47Q96LD4 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM47Q96LD4 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM47Q96LD4 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM47Q96LD4 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM47Q96LD4 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM47Q96LD4 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM47Q96LD4 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM47Q96LD4 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM47Q96LD4 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM47Q96LD4 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM47Q96LD4 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM47Q96LD4 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM47Q96LD4 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM47Q96LD4 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM47Q96LD4 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM47Q96LD4 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM47Q96LD4 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM47Q96LD4 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM47Q96LD4 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM47Q96LD4 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM47Q96LD4 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM47Q96LD4 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM47Q96LD4 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
TRIM47Q96LD4 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM47Q96LD4 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM47Q96LD4 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM47Q96LD4 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM47Q96LD4 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM47Q96LD4 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM47Q96LD4 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM47Q96LD4 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM47Q96LD4 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM47Q96LD4 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM47Q96LD4 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM47Q96LD4 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM47Q96LD4 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM47Q96LD4 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM47Q96LD4 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM47Q96LD4 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM47Q96LD4 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM47Q96LD4 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM47Q96LD4 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms