Protein–RNA interactions for Protein: Q96KT6

LINC00208, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00208, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00208Q96KT6 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms