Protein–RNA interactions for Protein: Q96KF2

PRAC1, Small nuclear protein PRAC1, humanhuman

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAC1Q96KF2 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
PRAC1Q96KF2 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
PRAC1Q96KF2 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
PRAC1Q96KF2 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
PRAC1Q96KF2 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
PRAC1Q96KF2 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
PRAC1Q96KF2 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
PRAC1Q96KF2 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
PRAC1Q96KF2 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC9.17□□□□□ -0.94
PRAC1Q96KF2 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
PRAC1Q96KF2 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
PRAC1Q96KF2 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
PRAC1Q96KF2 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
PRAC1Q96KF2 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
PRAC1Q96KF2 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
PRAC1Q96KF2 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
PRAC1Q96KF2 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
PRAC1Q96KF2 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
PRAC1Q96KF2 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
PRAC1Q96KF2 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
PRAC1Q96KF2 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
PRAC1Q96KF2 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
PRAC1Q96KF2 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
PRAC1Q96KF2 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
PRAC1Q96KF2 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
PRAC1Q96KF2 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
PRAC1Q96KF2 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
PRAC1Q96KF2 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
PRAC1Q96KF2 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
PRAC1Q96KF2 TUBGCP6-201ENST00000248846 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
PRAC1Q96KF2 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
PRAC1Q96KF2 LIMD2-201ENST00000259006 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
PRAC1Q96KF2 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
PRAC1Q96KF2 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
PRAC1Q96KF2 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
PRAC1Q96KF2 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
PRAC1Q96KF2 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
PRAC1Q96KF2 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
PRAC1Q96KF2 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
PRAC1Q96KF2 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
PRAC1Q96KF2 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
PRAC1Q96KF2 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
PRAC1Q96KF2 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
PRAC1Q96KF2 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
PRAC1Q96KF2 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
PRAC1Q96KF2 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
PRAC1Q96KF2 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
PRAC1Q96KF2 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
PRAC1Q96KF2 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
PRAC1Q96KF2 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
PRAC1Q96KF2 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
PRAC1Q96KF2 RNF216-202ENST00000389902 3293 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
PRAC1Q96KF2 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
PRAC1Q96KF2 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
PRAC1Q96KF2 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
PRAC1Q96KF2 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
PRAC1Q96KF2 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
PRAC1Q96KF2 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.16□□□□□ -0.94
PRAC1Q96KF2 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
PRAC1Q96KF2 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
PRAC1Q96KF2 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
PRAC1Q96KF2 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
PRAC1Q96KF2 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
PRAC1Q96KF2 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
PRAC1Q96KF2 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
PRAC1Q96KF2 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
PRAC1Q96KF2 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
PRAC1Q96KF2 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
PRAC1Q96KF2 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
PRAC1Q96KF2 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
PRAC1Q96KF2 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
PRAC1Q96KF2 AL139385.1-201ENST00000611744 3272 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
PRAC1Q96KF2 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
PRAC1Q96KF2 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
PRAC1Q96KF2 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
PRAC1Q96KF2 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
PRAC1Q96KF2 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
PRAC1Q96KF2 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
PRAC1Q96KF2 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
PRAC1Q96KF2 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC9.16□□□□□ -0.94
PRAC1Q96KF2 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
PRAC1Q96KF2 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC9.16□□□□□ -0.94
PRAC1Q96KF2 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
PRAC1Q96KF2 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
PRAC1Q96KF2 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
PRAC1Q96KF2 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
PRAC1Q96KF2 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
PRAC1Q96KF2 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
PRAC1Q96KF2 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
PRAC1Q96KF2 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
PRAC1Q96KF2 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
PRAC1Q96KF2 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
PRAC1Q96KF2 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
PRAC1Q96KF2 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
PRAC1Q96KF2 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
PRAC1Q96KF2 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
PRAC1Q96KF2 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
PRAC1Q96KF2 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.94
PRAC1Q96KF2 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.94
PRAC1Q96KF2 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms