Protein–RNA interactions for Protein: Q96JQ0

DCHS1, Protocadherin-16, humanhuman

Predictions only

Length 3,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCHS1Q96JQ0 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DCHS1Q96JQ0 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
DCHS1Q96JQ0 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DCHS1Q96JQ0 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DCHS1Q96JQ0 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DCHS1Q96JQ0 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DCHS1Q96JQ0 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DCHS1Q96JQ0 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DCHS1Q96JQ0 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DCHS1Q96JQ0 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DCHS1Q96JQ0 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DCHS1Q96JQ0 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DCHS1Q96JQ0 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DCHS1Q96JQ0 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
DCHS1Q96JQ0 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DCHS1Q96JQ0 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
DCHS1Q96JQ0 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DCHS1Q96JQ0 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DCHS1Q96JQ0 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DCHS1Q96JQ0 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DCHS1Q96JQ0 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
DCHS1Q96JQ0 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DCHS1Q96JQ0 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DCHS1Q96JQ0 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DCHS1Q96JQ0 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DCHS1Q96JQ0 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
DCHS1Q96JQ0 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DCHS1Q96JQ0 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DCHS1Q96JQ0 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DCHS1Q96JQ0 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DCHS1Q96JQ0 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DCHS1Q96JQ0 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DCHS1Q96JQ0 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
DCHS1Q96JQ0 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DCHS1Q96JQ0 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DCHS1Q96JQ0 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DCHS1Q96JQ0 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DCHS1Q96JQ0 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DCHS1Q96JQ0 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DCHS1Q96JQ0 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DCHS1Q96JQ0 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DCHS1Q96JQ0 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DCHS1Q96JQ0 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
DCHS1Q96JQ0 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
DCHS1Q96JQ0 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DCHS1Q96JQ0 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DCHS1Q96JQ0 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DCHS1Q96JQ0 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DCHS1Q96JQ0 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DCHS1Q96JQ0 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DCHS1Q96JQ0 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DCHS1Q96JQ0 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DCHS1Q96JQ0 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
DCHS1Q96JQ0 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DCHS1Q96JQ0 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DCHS1Q96JQ0 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DCHS1Q96JQ0 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DCHS1Q96JQ0 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DCHS1Q96JQ0 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DCHS1Q96JQ0 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DCHS1Q96JQ0 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
DCHS1Q96JQ0 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DCHS1Q96JQ0 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
DCHS1Q96JQ0 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DCHS1Q96JQ0 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DCHS1Q96JQ0 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DCHS1Q96JQ0 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DCHS1Q96JQ0 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
DCHS1Q96JQ0 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
DCHS1Q96JQ0 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DCHS1Q96JQ0 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DCHS1Q96JQ0 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
DCHS1Q96JQ0 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DCHS1Q96JQ0 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
DCHS1Q96JQ0 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
DCHS1Q96JQ0 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
DCHS1Q96JQ0 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
DCHS1Q96JQ0 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
DCHS1Q96JQ0 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
DCHS1Q96JQ0 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
DCHS1Q96JQ0 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DCHS1Q96JQ0 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DCHS1Q96JQ0 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DCHS1Q96JQ0 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
DCHS1Q96JQ0 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DCHS1Q96JQ0 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
DCHS1Q96JQ0 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
DCHS1Q96JQ0 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
DCHS1Q96JQ0 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
DCHS1Q96JQ0 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DCHS1Q96JQ0 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
DCHS1Q96JQ0 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
DCHS1Q96JQ0 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DCHS1Q96JQ0 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
DCHS1Q96JQ0 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DCHS1Q96JQ0 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
DCHS1Q96JQ0 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
DCHS1Q96JQ0 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
DCHS1Q96JQ0 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DCHS1Q96JQ0 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.3 ms